因為胰腺炎和急性腎盂腎炎疼痛的部位和性質相似，因此急性腎盂腎炎有時可誤診為胰腺炎。血清淀粉酶升高，尿液檢查正常有助于胰腺炎的確診并可排除急性腎盂腎炎。

　　基底部肺炎是一種引起肋下疼痛的發(fā)熱性疾病，但其疼痛有胸膜炎性質，胸部X線檢查有異常表現。

　　有時急性闌尾炎、膽囊炎、憩室炎等急腹癥必須與急性腎盂腎炎相鑒別，盡管早期的癥狀和體征相似，醫(yī)學`教育網搜集整理但尿液分析和其他實驗室檢查有助于鑒別診斷。

　　女性急性盆腔炎患者須與急性腎盂腎炎相鑒別。體格檢查發(fā)現有特征性體征和尿液培養(yǎng)陰性提示急性盆腔炎。

　　在男性患者，急性腎盂腎炎須要與急性前列腺炎、急性附睪睪丸炎相鑒別。

　　急性腎盂腎炎還須與腎膿腫、腎周圍膿腫鑒別。