資源分配包括宏觀資源分配和微觀資源分配。醫(yī)療衛(wèi)生資源的宏觀分配指在國家能得到的全部資源中應該把多少分配給衛(wèi)生保健，分配給衛(wèi)生保健的資源在醫(yī)療衛(wèi)生各部門之間如何分配，如癌癥研究應分多少，預防醫(yī)學應分多少，高技術醫(yī)學應分多少等。宏觀分配還必須解決如下問題：政府是否應負責醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)，還是把醫(yī)療事業(yè)留給市場，如果政府應負責，則應將多少預算用于醫(yī)療衛(wèi)生。如何最有效地使用分配給醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)的預算，如預算應集中于腎透析、器官移植、重癥監(jiān)護這些搶救方法，還是集中于疾病的預防；哪些疾病應優(yōu)先得到資源的分配；以及為改變個人行為模式和生活方式（如吸煙），政府應投入多少資源等等。資源的微觀分配指醫(yī)務人員和醫(yī)療行政單位根據(jù)什么原則把衛(wèi)生資源分配給病人，怎樣分配才算公正合理。

當涉及稀有資源時，哪些病人可優(yōu)先獲得資源（如有兩個病人都需要腎移植，但只有一個腎可供移植時）。為了進行微觀分配，首先需要規(guī)定一些規(guī)則和程序來決定哪些人可以得到這種資源，即根據(jù)適應癥、年齡、治療成功的可能和希望、預期壽命和生命質(zhì)量等主要是醫(yī)學的標準進行初篩；然后再規(guī)定一些規(guī)則和程序從這范圍中最后決定哪些人得到這種資源。這組規(guī)則和程序的規(guī)定常常要參照社會標準：病人的地位和作用、過去的成就、潛在的貢獻等。但對社會標準，爭議較多。

衛(wèi)生政策中最有爭論的問題是一個國家是否應該讓醫(yī)療衛(wèi)生社會化，如應實行公費醫(yī)療或醫(yī)療保險，還是讓醫(yī)療衛(wèi)生商品化，還是采取某種混合折衷的方式（如醫(yī)療衛(wèi)生的基本需要由國家負責，而高技術醫(yī)學則由病人自己根據(jù)收入購買）。