蟲草的儲藏要點是防潮、防蛀和防蟲。如果量很少，而且儲藏時間也很短的話只需要放在陰涼干燥的地方就行了?；?qū)⑵渑c花椒或丹皮放在密閉的玻璃中，置冰箱中冷藏，隨用隨取。如果量大或者需要放置較長時間最好放蟲草的地方放一些硅膠之類的干燥劑，因為，剛買來的蟲草都有些潮而且久置容易發(fā)霉、生蟲。

蟲草受潮后要化苗，即蟲體成空過殼，捏后變扁，但蟲草質(zhì)量降低。若用白酒噴撒蟲草(每千克用250ml酒)，噴后再噴水，用硫磺熏，可保幾個月不化苗。發(fā)現(xiàn)蟲草受潮后，應立即曝曬。若生蟲，可用硫磺熏之，或用炭火微微烘焙，事后篩去害蟲蟲體與蛀屑。蟲草保存不宜過久，過久則藥效降低。

80年代以來，我國各地逐步應用了除氧保鮮技術，并應用于冬蟲夏草的保管。研究表明，采用除氧保鮮養(yǎng)護的蟲草，在長達2年的貯藏期內(nèi)，品質(zhì)完好，無蟲蛀、無損耗。與氯化苦熏蒸法相比，有很多優(yōu)點，不但蟲草粗蛋白質(zhì)總含量較后者為高，而且無毒、無害，殺蟲滅菌迅速徹底，不影響蟲草的有效成分和商品質(zhì)量，還方便貯藏與檢查，安全性強。