用量小于30mg/m2時，口服吸收良好，1小時～5小時血藥濃度達最高峰。部分經(jīng)肝細胞代謝轉化為谷氨酸鹽，另有部分通過胃腸道細菌代謝。主要經(jīng)腎（約40～90%）排泄，大多以原形藥排出體外；小于10%的藥物通過膽汁排泄，T1/2α為1小時；T1/2β為二室型：初期為2～3小時；終末期為8～10小時。少量甲氨喋呤及其代謝產(chǎn)物可以結合型形式貯存于腎臟和肝臟等組織中長達數(shù)月，在有胸腔或腹腔積液情況下，本品的清除速度明顯減緩。清除率個體差別極大，老年患者更甚。