新的抗菌藥物出現(xiàn)，總是伴隨著細(xì)菌耐藥性的產(chǎn)生，雖然目前細(xì)菌對(duì)碳青霉烯類的耐藥性相當(dāng)?shù)?，?duì)常見病原菌的敏感率相當(dāng)高，但碳青霉烯類與其他β-內(nèi)酰胺類一樣，在臨床應(yīng)用后即出現(xiàn)耐藥菌株。亞胺培南在臨床上已應(yīng)用多年，對(duì)其耐藥的菌株有：黃單孢菌、糞腸球菌和耐甲氧青霉素葡萄球菌。對(duì)亞胺培南耐藥的綠膿桿菌對(duì)美羅培南仍敏感。

眼下臨床主要致病菌對(duì)碳青霉烯類的耐藥很少見，耐藥機(jī)制主要有：1.青霉素結(jié)合蛋白結(jié)合力下降，主要見于耐甲氧西林葡萄球菌及某些腸球菌；2.Ⅰ型β-內(nèi)酰胺酶水解碳青霉烯類的微弱活性加上細(xì)菌對(duì)碳青霉烯類通透性下降致耐藥性產(chǎn)生，主要見于一些腸桿菌及綠膿桿菌；3.菌株產(chǎn)生含鋅β-內(nèi)酰胺酶水解碳青霉烯類，這些菌株大多為臨床非常見的病原菌。