有機磷化合物在體內的主要代謝途徑包括水解、氧化和結合反應。其中，水解是最主要的代謝方式，通過血漿中的酯酶或肝臟微粒體中的羧酸酯酶將有機磷化合物分解為無毒或低毒性的磷酸產(chǎn)物。此外，部分有機磷化合物還可以被氧化形成更加極性的代謝物，或者與葡萄糖醛酸、硫酸鹽等物質結合，以利于從尿液中排出。這些代謝過程有助于減少體內有機磷化合物的毒性，但某些代謝產(chǎn)物仍可能具有一定的生物活性或毒性。