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丘腦底部是丘腦與中腦被蓋之間的過渡區(qū)，內側和嘴側是下 丘腦，腹側和外側界是中腦大腦腳和內囊。除紅核和黑質的嘴側，上達該區(qū)外，還包括了丘腦底核、未定帶核底丘腦網狀核團，以及經過該區(qū)底纖維束即紅核前區(qū)（Forel - H區(qū)）、豆狀袢和豆狀束（H2區(qū)）和丘腦束（H1區(qū)）。

丘腦底核（subthalamic nucleus， STN）又稱Luys體，是丘腦底部中的最主要核團，位于底丘腦和中腦的移行部，在冠狀切面上呈雙凸鏡形，位于乳頭體背外側，緊貼內囊后肢的內側緣和大腦腳底上部的背內側面。STN的背內側是豆狀束的延續(xù)，即H2 區(qū)；此核的下部位于大腦腳底的背面，其后端伸至底丘腦與中腦被蓋的移行區(qū)，且與黑質的上端相延續(xù)，居黑質前端的背外側。

丘腦底核的傳入纖維來自大腦皮質（4、6區(qū)）、蒼白球外側部、 丘腦和網狀結構，傳出纖維投射至蒼白球和黑質網狀部。其中最重要的是，丘腦底核發(fā)出興奮性的谷氨酸能纖維投射至Gpi -SNr 復合體，Gpe則發(fā)出移植性GABA能纖維投射至丘腦底核。

未定帶是一條灰質帶，位于丘腦與豆狀核之間，向外與丘腦網狀核相續(xù)。接受蒼白球和大腦皮層運動前區(qū)的纖維，與丘腦板內核群、紅核及中腦被蓋之間有密切的纖維聯(lián)系。

紅核前區(qū)（Forel-H區(qū)）又稱Forel被蓋區(qū)，此區(qū)的細胞稱 為紅核前區(qū)核。

其纖維包括齒狀核丘腦束、紅核丘腦束和豆狀束，后者中止于紅核前區(qū)核。由此核發(fā)出的纖維止于紅核和中腦網狀結構。

豆狀束（lenticular fasciculus）又稱H1區(qū)，位于蒼白球內側部的背側，由蒼白球背內側發(fā)出的纖維組成，經丘腦底核的嘴側 穿過內囊。

在未定帶的腹側，此束比較明顯，此束向尾側與豆狀袢合并，形成紅核前區(qū)。豆狀袢（lenticular ansa）的纖維起自蒼白球腹側，向腹內側和嘴側繞過內囊后腳，進入紅核前區(qū)。丘腦束又稱H2區(qū)，位于丘腦的腹側，由幾束纖維組成。

來自豆狀束的纖維，沿未定帶的背側面向背外側，中止于丘腦腹前核和腹中間核；另一部分纖維離開丘腦束，向背側、尾側核內側，中止于丘腦板內核群的中央中核；尚有來自小腦齒狀核的纖維，經丘腦束中止于丘腦腹中間核的嘴側部，有的纖維中止于嘴側的丘腦板內核。

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