| 會議日期 | 2019-08-08至 2019-08-09 |
| 會議地點 | 廣東廣州 |
| 會議學科 | 其他臨床�？颇[瘤科 |
| 主辦單位 | 上海遐永醫(yī)藥科技有限公司 |
| 學分情況 | 無 |
培訓預期：
1. 通過兩整天培訓，掌握TCGA，GEO數據庫的使用、下載及高通量數據分析思路和實用操作知識點。
2. 可以獨立完成一篇基于公共數據庫的高通量數據挖掘分析。
3. 課后贈送1小時全場串聯視頻，用于學員復習。
4. 贈送一份最近5年的高價值國自然標書（醫(yī)藥加高價值標書庫里面選擇）
5. 講師團隊贈送TCGA數據庫甲基化、基因表達譜整合分析報告和疾病mRNA+lncRNA分析報告
講師簡介：宋偉博士
成果：參與完成了近百篇軟件著作權和發(fā)明專利的撰寫和申請；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數據庫的分析和構建；完成個體基因檢測流程和無創(chuàng)唐篩流程的開發(fā)。
研究方向：有近十年的生信分析經驗，擅長方向有轉錄組測序分析、芯片數據分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關聯分析、項目分析思路設計以及個性化分析等，精通perl、R等編程語言。
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TCGA&GEO高通量數據挖掘分析班課表 |
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日期 |
時間 |
課程安排 |
內容介紹 |
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周六上午 |
9:00-10:00 |
生信簡介 |
生物信息介紹 |
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高通量：測序及芯片介紹——多組學：轉錄組學、基因組學、表觀組學、宏基因組學等 |
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經典生信SCI文章的思路解讀，了解TCGA數據庫、GEO數據庫及高通量測序數據的挖掘獲得創(chuàng)新結論并發(fā)文章的思路 |
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10:00-10:15 |
茶歇 |
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10:15-12:00 |
TCGA數據庫 NCBI GEO數據庫 |
TCGA數據庫：最全的癌癥高通量數據公共庫(簡介) |
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TCGA數據庫的產生過程 |
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TCGA官方數據庫的介紹和使用（包含了轉錄組、基因組、表觀組和臨床信息數據） |
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GEO數據庫介紹及使用：高通量芯片數據查找、篩選、探針轉換、差異分析等。 |
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12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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周六下午 |
13:30-15:00 |
TCGA相關下載工具 |
TCGA數據庫據下載：RNA-seq數據、miRNA-seq數據、甲基化數據、基因組數據及臨床信息數據的下載 |
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15:00-15:20 |
茶歇 |
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15:20-17:00 |
TCGA相關分析工具 |
TCGA數據分析——突變分析、差異分析、關聯分析、生存分析、miRNA調控靶基因分析等。 |
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獲得生存曲線圖（KM曲線，分為臨床因素和基因表達兩種KM曲線） |
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周日上午 |
8:30-10:30 |
TCGA數據后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) |
功能富集分析——GO富集和KEGG pathway富集分析 |
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聚類熱圖制作 |
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10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-12:00 |
TCGA數據后續(xù)高級分析工具實戰(zhàn) |
蛋白互作分析（PPI）及網絡圖構建 |
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網絡分析及hub蛋白/基因獲得。 |
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12:00-13:30 |
午餐及午休 |
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周日下午 |
13:30-15:00 |
TCGA數據庫與GEO數據庫挖掘 |
基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全轉錄組整合分析思路演練 基于TCGA的甲基化與轉錄組整合分析思路演練 基于GEO數據庫多套數據整合（meta）分析思路演練 |
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15:00-15:20 |
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15:20-16:30 |
整體演練并錄屏 |
在電腦上快速完成從頭到尾的一套數據實戰(zhàn)，及答疑 |
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注意事項：學員需自己帶電腦，要求為windows系統(tǒng)，現場不得錄音錄像，上課所用軟件為Heml，GSE |
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【收費標準】
注冊費用：2800元/人，（會務費包含電子版教材、午餐，住宿費自理。）
優(yōu)惠政策：
1. 提前報名并付款的，可以預先拿到學習資料
2. 三人組團報名，每人優(yōu)惠100元
3. 四人組團報名，每人優(yōu)惠200元，
4. 五人組團報名繳費，額外帶一人免費注冊同價值學習班！
注意事項：必須攜帶win7以上系統(tǒng)的電腦，現場不得錄音錄像。提前安裝好Heml和GSE軟件（可提前向主辦方索要安裝包）
可開具正規(guī)會務費發(fā)票，提供紙質蓋章邀請函；如需要電子版正式邀請函，請回復郵件或添加會務組微信索要；
【聯系我們】
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