醫(yī)學(xué)會議中心

　　開班時間：2014年11月21-27日

上課地點：杭州 浙江大學(xué)華家池校區(qū)隨著眾多生物基因組測序項目的完成，生物學(xué)數(shù)據(jù)正在加速度增長。如何科學(xué)地分析和注釋這些高通量數(shù)據(jù)，已成為生物學(xué)工作者急需學(xué)習(xí)和解決的問題。

　　浙江大學(xué)“基因組科學(xué)”研習(xí)班邀請北京基因組所于軍教授、胡松年教授為您講授基因組學(xué)基礎(chǔ)知識和前沿進展、基因轉(zhuǎn)錄組的測定及分析、基因芯片、二代測序等實驗技術(shù)的關(guān)鍵事項；浙江大學(xué)楊軍教授、陳銘教授等講解系統(tǒng)生物學(xué)及高通量分析研究方法和思路。

　　本研習(xí)班多次獲得浙江大學(xué)優(yōu)秀項目創(chuàng)新獎，目前已舉辦43期，學(xué)員來自全國30余個省市，累計培訓(xùn)學(xué)員4200余名。每次研習(xí)班不乏教授、博導(dǎo)參加，更受到博士后、碩博生等年輕學(xué)者的青睞。他們中有一些帶著課題或問題前來交流和聯(lián)系，不少學(xué)員通過本研習(xí)班建立了長期協(xié)作關(guān)系，共同申請國家973、863課題，共同發(fā)表論文，其中不少優(yōu)秀的研究成果，已在SCI期刊上發(fā)表。

　　一、培訓(xùn)班上課內(nèi)容上課內(nèi)容涵蓋“基因組學(xué)—蛋白質(zhì)組學(xué)—系統(tǒng)生物學(xué)”的研究方法、技術(shù)思路、前沿進展及其在各生物學(xué)科中的應(yīng)用。

　　核心課程包括：1. 基因組的比較研究、DNA測序技術(shù)原理與進展（講課人：于 軍 教授）

　　2. 轉(zhuǎn)錄組的測定與分析、大規(guī)模測序方法及應(yīng)用、微生物基因組學(xué)（講課人：胡松年教授）

　　3. 系統(tǒng)生物學(xué)建模分析及高通量分析技術(shù)應(yīng)用（講課人：楊軍、陳銘教授等）

　　4. 蛋白質(zhì)組學(xué)概論及應(yīng)用 （講課人：鐘伯雄教授）

　　二、培訓(xùn)班上機內(nèi)容上機實習(xí)課采用 “跟我學(xué)”方式，學(xué)習(xí)實踐各類基礎(chǔ)生物信息學(xué)軟件，每人一臺PC機跟著大屏幕一步步學(xué)會基因組、蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析的基本方法。

　　主要內(nèi)容如下：實習(xí)一： 基因組數(shù)據(jù)注釋和功能分析通過序列比對工具BLAST的學(xué)習(xí)，了解基因功能注釋的原理；介紹多序列聯(lián)配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4，掌握系統(tǒng)發(fā)生樹繪制的基本方法，認(rèn)識基因復(fù)制在進化上的功能。

　　實習(xí)二： 核苷酸序列分析學(xué)習(xí)基因序列分析常用的數(shù)據(jù)庫和軟件，包括：基因預(yù)測，編碼區(qū)結(jié)構(gòu)分析，選擇性剪切分析，基因啟動子預(yù)測，基因調(diào)控元件預(yù)測，密碼子偏好性分析等內(nèi)容。

　　實習(xí)三： 芯片的基本數(shù)據(jù)處理和分析使用TM4軟件來實現(xiàn)芯片的數(shù)據(jù)采集，低質(zhì)量過濾，標(biāo)準(zhǔn)化處理及聚類等可視化分析；使用GenMAPP軟件挖掘芯片數(shù)據(jù)在代謝途徑中的生物學(xué)意義；介紹NCBI GEO數(shù)據(jù)庫，學(xué)習(xí)檢索和提交芯片數(shù)據(jù)。

　　實習(xí)四：蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析從數(shù)據(jù)庫搜索感興趣的蛋白質(zhì)氨基酸序列開始，接著對蛋白質(zhì)基本理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)、和三維空間結(jié)構(gòu)和序列模體進行分析，預(yù)測目標(biāo)蛋白的生物功能。

　　實習(xí)五： 蛋白質(zhì)組質(zhì)譜分析使用X！Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)，將質(zhì)譜結(jié)果匹配到蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫鑒定蛋白；使用TPP軟件包進行統(tǒng)計學(xué)分析和優(yōu)化檢索結(jié)果練習(xí)。

　　三、培訓(xùn)對象1、無生物信息學(xué)背景，希望了解生物信息學(xué)的學(xué)員；2、計劃開展各類組學(xué)研究的科研人員；3、已有組學(xué)數(shù)據(jù)需了解分析方法的研究人員；4、有志從事生物信息學(xué)相關(guān)工作的學(xué)生或者技術(shù)人員。

　　四、報名方法若有參加意向，請將以下報名表回執(zhí)。doc，我們會即刻回函并在浙江大學(xué)繼續(xù)教育系統(tǒng)錄入，待排定課表后發(fā)給您詳細課程表。待您再次確認(rèn)后，發(fā)給您報到通知并排定上機號。培訓(xùn)結(jié)束，發(fā)放浙江大學(xué)繼續(xù)教育證書。

　　五、教材“DNA和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)分析工具”（第三版）， 薛慶中等編著，科學(xué)出版社出版 2012年6月發(fā)行。

　　六、其他事項收費標(biāo)準(zhǔn)：注冊費為￥3000/人，安排食宿、費用自理。

　　聯(lián) 系 人：沈志成 13958194424   咨詢電話：0571-86971539電子郵件地址：zcniszc@zju.edu.cn； genetrain@zju.edu.cn