| 會議日期 | 2019-11-28至 2019-12-01 |
| 會議地點 | 江蘇南京 |
| 會議學科 | 基礎醫(yī)學微生物 |
| 主辦單位 | 中科成創(chuàng)（北京）生物技術有限公司 |
| 學分情況 | 無 |
“微生物宏基因組學及后期數(shù)據(jù)分析專題培訓班”的通知
培訓對象：
大中專院校生物信息、生物計算、生命科學、醫(yī)學、化學、農(nóng)學、計算機科學、數(shù)學類專業(yè)的課程負責人、一線教師、教研室骨干人員、教學管理人員；科研單位從事生物、生命科學、微生物研究的相關人員；生物、醫(yī)藥、化學及相關企業(yè)的領導與技術骨干。
時間地點： 2019年11月28日——12月1日 江蘇 南京
（時間安排：第1天報到，授課3天）
培訓內(nèi)容：
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理論內(nèi)容： 一、宏基因組學 1. 16S rDNA AMPLICON SEQUENCING 法 1.1. 測序平臺、引物設計及區(qū)域選擇不同測序平臺、針對細菌、真菌不同微生物實驗設計 1.2. 測序量及采樣建議 針對水體、糞便、土壤、物體表面、口腔等不同生境 1.3. 分析流程圖 數(shù)據(jù)收集、數(shù)據(jù)預處理、數(shù)據(jù)分析 1.4. 結(jié)果解析 1.4.1 OTU聚類 1.4.2 物種注釋 1.4.3 物種分布情況 1.4.4 樣品復雜度分析：α多樣性 Coverage Chao指數(shù) ACE指數(shù) Shannon曲線 Richness rarefaction曲線 1.4.5 多樣品比較分析：β多樣性 樣品間物種豐度熱圖 排序分析： PCA分析 PCoA分析 NMDS分析 Unifrac分析 樣品聚類分析 2. DSS （direct shotgun sequencing）法 2.1. 分析流程 2.2. 功能注釋分析 2.3. 代謝途徑解析 二、宏轉(zhuǎn)錄組學 1 介紹 2 物種組成、功能及代謝途徑分析 宏基因組優(yōu)勢菌分析 1.泛基因組分析 2.宏基因組中的優(yōu)勢菌株單基因組分析 上機實習： 一、宏基因組中的優(yōu)勢菌株單基因組常規(guī)分析流程 1.原始數(shù)據(jù)評估 （fastqc） 2 基因組拼接、畫圖（CGview等） 3 功能注釋 （KEGG、CARD、Resfinder等） 4 進化樹分析 （MEGA、evolview） 5 多菌株泛基因組分析 (PanGP) 二、宏基因組學（16S部分）介紹以及上機操作 1.Virtual box 及Qiime2 安裝 2.Linux基礎知識介紹 3.Qiime2：數(shù)據(jù)處理， 質(zhì)控， 生成feature， 進化樹構(gòu)建， 多樣性分析， 差異分析， 物種注釋 三、R語言基礎及宏基因組相關統(tǒng)計分析 1.常用基本命令 變量賦值 文件讀寫 常用的統(tǒng)計函數(shù) 2.差異OTU及差異菌群分析 wilcox檢驗 3.相關性檢驗 差異OTU與樣本臨床信息相關性檢驗 4.alpha多樣性 5.beta多樣性 6.PCoA 7.機器學習 邏輯回歸 隨機森林 svm |
報名辦法及費用：
每人￥3980元（含報名費、培訓費、資料費、上機費）
團隊報名：4+1優(yōu)惠。（5位其中1位免除費用）
食宿可統(tǒng)一安排，費用自理。各單位人員報名參加，報名回執(zhí)表請回傳至會務處即可。
如單位有內(nèi)訓需求，請將內(nèi)訓方案傳至會務組，根據(jù)單位需求安排相應專家進行授課
聯(lián)系方式：
聯(lián)系人:白嵐 138 1194 3959
報名郵箱：zkcc_BIS@vip.163.com
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