| 會議日期 | 2018-07-20至 2018-07-24 |
| 會議地點 | 云南昆明 |
| 會議學(xué)科 | 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)生物學(xué) |
| 主辦單位 | 北京中科云暢應(yīng)用技術(shù)研究院 |
| 學(xué)分情況 | 無 |
各有關(guān)單位：
隨著眾多生物基因組測序項目的完成，生物學(xué)數(shù)據(jù)正在加速度增長。如何科學(xué)地分析和注釋這些高通量數(shù)據(jù)，已成為生物學(xué)工作者急需學(xué)習(xí)和解決的問題。為進一步推動我國生物信息學(xué)方面的發(fā)展，提高從業(yè)人員的技術(shù)水平，由北京中科云暢應(yīng)用技術(shù)研究院與中科院北京基因組研究所基因組科學(xué)與信息重點實驗室聯(lián)合舉辦“高通量測序應(yīng)用最新技術(shù)與數(shù)據(jù)分析”高級培訓(xùn)班，并由北京中科潤開生物科技有限公司具體承辦，具體事宜通知如下：
一、課程特點：
1、系統(tǒng)介紹科研項目如何從大思路著眼進行海量數(shù)據(jù)挖掘；
2、結(jié)合各大項目實踐經(jīng)驗，詳細介紹多種數(shù)據(jù)分析軟件的使用方法；
3、經(jīng)典項目總體設(shè)計思路、遇到的困難及解決方案；
4、理論課與實踐課相結(jié)合，講師與學(xué)員研討的方式進行；
5、精心挑選相應(yīng)的上機軟件，為每位學(xué)員提供實際操作的機會；
6、課下主講老師為您所遇到的瓶頸問題提供個性化解答。
二、培訓(xùn)對象：
大中專院校生物信息、生物計算、生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)、農(nóng)學(xué)、計算機科學(xué)、數(shù)學(xué)類專業(yè)的課程負責(zé)人、一線教師、教研室骨干人員、教學(xué)管理人員；科研單位從事生物、生命科學(xué)、微生物研究的相關(guān)人員；生物、醫(yī)藥、化學(xué)及相關(guān)企業(yè)的領(lǐng)導(dǎo)與技術(shù)骨干。
三、時間地點： 2018年7月20日——7月24日 昆明
（時間安排：第1天報到，授課4天）
四、培訓(xùn)內(nèi)容：
| 章節(jié) | 內(nèi) 容 |
| 生物信息學(xué)介紹 | 生物信息學(xué)介紹與前沿技術(shù)動態(tài) |
| 新物種基因組測序策略及基因組文章構(gòu)成分析 | 1、新物種的基因組測序的意義 2、基因組從頭測序技術(shù)路線 3、數(shù)據(jù)獲得與處理 4、基因組基本分析 |
| 新物種基因組測序策略及基因組文章構(gòu)成分析 | 1、轉(zhuǎn)錄組基本分析 2、基因組比較分析 3、數(shù)據(jù)挖掘與生物功能 4、基因組文章構(gòu)思的關(guān)鍵基本共識 |
| 微生物基因組學(xué) |
1、微生物基因組研究概況 2、微生物基因組的特點 3微生物基因組研究的意義 4、原核生物轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究 5、單個基因組分析流程 6、泛基因組分析流程 宏基因組/宏轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用 |
| Linux命令簡介 | 1、Linux背景介紹 2、常用命令 3、權(quán)限管理 4、進程查看等 |
| R語言基礎(chǔ)以及ggplot2繪圖 | 1、R語言基本介紹 2、R語言基本運算、向量函數(shù) 3、R語言數(shù)據(jù)讀入以及導(dǎo)出 4、ggplot2基本繪圖 （條形圖、散點圖、折線圖等） |
| 使用R語言進行生物信息學(xué)相關(guān)的分析 |
1、高通量測序RNA-seq數(shù)據(jù)的格式、質(zhì)量值計算、優(yōu)缺點 2、無參考基因組-數(shù)據(jù)拼接軟件介紹 3、表達量計算軟件介紹 上機操作實習(xí)： （i）利用bioconductor包EdgeR進行差異基因分析 （ii）利用bioconductor包degeR進行差異基因分析 （iii）利用熱圖進行聚類分析 （iv）GO、KEGG等功能聚類分析及用perl語言實現(xiàn) BioEdit、WEGO等常用生物軟件介紹 |
| 生物信息學(xué)專業(yè)常用工具及繪圖方法 | 1、利用fastQC進行質(zhì)量評估 2、BLAST簡單介紹 3、微生物基因組圈圖（CGview, OGdraw） 4、功能注釋（KEGG（KAAS），Islandviewer，ARDB） 5、進化樹分析（模型評估，進化樹構(gòu)建，注釋）MEGA 6、泛基因組學(xué)分析（PanGP） |
| 生物信息學(xué)專業(yè)常用工具及繪圖方法 | 1、Perl語言入門 2、基因組大小評估 3、基因組拼接質(zhì)量評估 （i） N50統(tǒng)計 （ii） 根據(jù)比對結(jié)果統(tǒng)計深度和覆蓋度 （iii）堿基GC含量等信息統(tǒng)計 4、基因結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果展示和提取 （i）GFF文件介紹 （ii）GFF內(nèi)容提取 5、使用circos繪制基因組圈圖 |
五、主講專家：
主講專家來自中科院基因所科研機構(gòu)的高級專家，擁有豐富的科研及工程技術(shù)經(jīng)驗，長期從事生物信息領(lǐng)域項目研究，具有資深的技術(shù)底蘊和專業(yè)背景。
報名辦法及費用：
費用4300元/人（含報名費、培訓(xùn)費、資料費、等相關(guān)費用）食宿統(tǒng)一安排，費用自理。請各有關(guān)部門統(tǒng)一組織本地區(qū)行政、企事業(yè)單位報名參加培訓(xùn)，各單位也可直接報名參加，報名回執(zhí)表請郵件回復(fù)至?xí)⻊?wù)組。
聯(lián)系人：于老師 咨詢電話：13691460671
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