| 會議日期 |
2017-03-23至 2017-03-26 |
| 會議地點 |
上海 |
| 會議學(xué)科 |
基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)生物學(xué) |
| 主辦單位 |
生物谷 |
| 學(xué)分情況 |
無 |
內(nèi)容簡介
轉(zhuǎn)錄組即某個物種或特定細胞在某一功能狀態(tài)下產(chǎn)生的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA（Non-coding RNA）。現(xiàn)在主流的非編碼RNA又包括：circRMA，microRNAs，及l(fā)ncRNAs.轉(zhuǎn)錄組學(xué)是研究細胞表型和功能的一個重要手段。與基因組不同的是，轉(zhuǎn)錄組的定義中包含了時間和 空間的限定。同一細胞在不同的生長時期及生長環(huán)境下，其基因表達情況是不完全相同的。轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-Seq）是指利用第二代高通量測序技術(shù)進行 cDNA測序，全面快速地獲取某一物種特定器官或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本。
基于高通量測序平臺的轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)能夠全面獲得物種特定組織或器官的轉(zhuǎn)錄本信息，從而進行基因表達水平研究、新轉(zhuǎn)錄本發(fā)現(xiàn)研究、轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)變異研究等。通過對轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的分析便能觀察疾病發(fā)生過程中病灶部位內(nèi)部的基因表達水平變化。在腫瘤研究中，使用RNA-seq技術(shù)也可以預(yù)測潛在的融合基因。同時，此項研究也能應(yīng)用在新lncRNA預(yù)測和已知lncRNA表達水平研究中。
2017年，生物谷將與國家基因檢測技術(shù)應(yīng)用示范中心共同舉辦本次全轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析及案例實踐班，同時，生物芯片上海國家工程研究中心和上海生物信息技術(shù)研究中心也將作為協(xié)辦方共同完成此次培訓(xùn)。
本次培訓(xùn)從生物信息基礎(chǔ)語言入門培訓(xùn)，到各類RNA測序分析介紹，再到lncRNA的鑒定與功能推斷，最后到R語言基礎(chǔ)與作圖。整個理論和實操的培訓(xùn)課程下來，相信您對全轉(zhuǎn)錄組的生物信息學(xué)應(yīng)用和分析會有一個全面的理解和運用，這也是本次培訓(xùn)班的辦學(xué)目的。
為此，我們熱忱的邀請您參加本次培訓(xùn)班，與您相聚在上海！
主要內(nèi)容
1、生物信息常用工具及數(shù)據(jù)庫介紹
2、Perl 語言入門
3、有參考基因組的RNA-seq分析介紹（mRNA+lncRNA+circRNA）
4、差異表達分析、可變剪接分析
5、lncRNA的鑒定與功能推斷及l(fā)ncRNA功能預(yù)測工具使用
6、R語言基礎(chǔ)與作圖及R語言常見作圖答疑
培訓(xùn)基本信息
適用人群：科研工作者、在讀研究生。
培訓(xùn)地點：上海
培訓(xùn)人數(shù)：人數(shù)限制50人。
培訓(xùn)時間：2017年3月23-26號
官網(wǎng)：
培訓(xùn)費用
理論課程：3300元/人（限50人）
理論+實際操作：5500元/人（限25人）（含數(shù)據(jù)分析咨詢服務(wù)）
【優(yōu)惠政策】
1、2016年12月31日之前打款可以享受理論班報名500元減免優(yōu)惠！
2、2016年12月31日之前打款可以享受理論+實操班報名700元減免優(yōu)惠。
【備注】
1、注冊費優(yōu)惠期限以到款時間為準(zhǔn)。
2、培訓(xùn)費用包含午餐費和資料費。如果您需要我們代為安排住宿，請一并告知，住宿統(tǒng)一安排，費用自理。
住宿信息
上海博雅酒店（準(zhǔn)5星） 標(biāo)準(zhǔn)間（含一早） 798元
上海浦東新區(qū)碧波路699號 ，近晨暉路 酒店電話： 021-61621168
上海張江和頤酒店 標(biāo)準(zhǔn)間（含兩早）420元
張江高科技園區(qū)蔡倫路782號（近哈雷路） 電話： 021-51320101
喆啡酒店上海張江店 標(biāo)準(zhǔn)間（含兩早）320元
上海浦東新區(qū)張江路1206號 電話：021-61105666
上海景宏商務(wù)酒店 標(biāo)準(zhǔn)間（含兩早） 180元
上海 浦東新區(qū) 張江建中路242弄88號 ，近紫薇路。電話：021-58335858
上海張江園區(qū)和頤酒店 標(biāo)準(zhǔn)間（含兩早）420元
上海浦東新區(qū)張江路605號 電話：021-38499588
日程
| 第一天（理論） |
| 時間 |
課程內(nèi)容 |
| 09:00 – 09:10 |
致歡迎詞 |
| 09:10 – 10:00 |
生物信息常用工具及數(shù)據(jù)庫介紹 |
| 10:00 – 10:50 |
Linux 基礎(chǔ)入門 |
| 10:50 – 11:10 |
茶歇 |
| 11:10 – 12:00 |
Linux 基礎(chǔ)入門 |
| 12:00 – 13:30 |
午休 |
| 13:30 – 14:20 |
Perl 語言入門 |
| 14:20 – 15:10 |
| 15:10 – 15:30 |
茶歇 |
| 15:30 – 16:20 |
轉(zhuǎn)錄組測序進展及熱點介紹 |
| 16:20 – 17:10 |
| 第二天（理論） |
| 09:00 – 09:50 |
有參考基因組的RNA-seq分析介紹（mRNA+lncRNA+circRNA） |
| 09:50 – 10:40 |
| 10:40 – 11:10 |
茶歇 |
| 11:10 – 12:00 |
lncRNA研究案例分享 |
| 12:00 – 13:30 |
午餐 |
| 13:30 – 14:20 |
de novo RNA-seq分析介紹 |
| 14:20 – 15:10 |
GO、KEGG功能注釋 |
| 15:10 – 15:30 |
茶歇 |
| 15:30 – 16:20 |
small RNA測序分析介紹 |
| 16:20 – 17:10 |
Small RNA研究案例分享 |
| 第三天（理論+實操） |
| 理論 |
| 09:00 – 09:50 |
差異表達分析 |
| 09:50 – 10:40 |
可變剪接分析 |
| 10:40 – 11:10 |
茶歇 |
| 11:10 – 12:00 |
融合基因分析 |
| 12:00 – 13:30 |
午休 |
| 實操 |
| 13:30 – 14:20 |
lncRNA的鑒定與功能推斷 |
| 14:20 – 15:10 |
| 15:10 – 15:30 |
茶歇 |
| 15:30 – 16:20 |
lncRNA功能預(yù)測工具使用 |
| 16:20 – 17:10 |
| 第四天（實操） |
| 09:00 – 09:50 |
R語言基礎(chǔ)與作圖 |
| 09:50 – 10:40 |
| 10:40 – 11:10 |
茶歇 |
| 11:10 – 12:00 |
R語言常見作圖答疑 |
| 12:00 – 13:30 |
午休 |
| 13:30 – 14:20 |
PCA，cluster，heatmap |
| 14:20 – 15:10 |
| 15:10 – 15:30 |
茶歇 |
| 15:30 – 16:45 |
共表達網(wǎng)絡(luò)及調(diào)控網(wǎng)絡(luò) |
| 16:45 – 17:00 |
結(jié)業(yè)&證書頒發(fā) |
