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2017生物信息數(shù)據(jù)處理與Perl語(yǔ)言編程應(yīng)用專題培訓(xùn)班

會(huì)議日期 2017-04-07至 2017-04-09
會(huì)議地點(diǎn) 北京海淀區(qū)
會(huì)議學(xué)科 其他
主辦單位
學(xué)分情況 無(wú)

  Perl語(yǔ)言作為絕大多數(shù)生物信息學(xué)工作者首選語(yǔ)言之一。北京市計(jì)算中心生物計(jì)算事業(yè)部針對(duì)沒(méi)有任何計(jì)算機(jī)語(yǔ)言的生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)等人員,且有從事生物信息學(xué)工作相關(guān)研究工作的需要。歡迎您報(bào)名參加!

  培訓(xùn)地點(diǎn):北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓

  培訓(xùn)時(shí)間:2017年4月7日-9日

  【培訓(xùn)特色】

  1、對(duì)口生物信息;

  2、非嚴(yán)格語(yǔ)法,適合初學(xué)

  3、功能強(qiáng)大、跨平臺(tái)

  4、有巨大的第三方代碼庫(kù)CPAN

  授課內(nèi)容

  概述

  1.生物信息學(xué)數(shù)據(jù)處理概述

  2.Perl語(yǔ)言簡(jiǎn)介特點(diǎn)與數(shù)據(jù)處理的優(yōu)勢(shì)與應(yīng)用范圍

  運(yùn)行調(diào)試

  3.Perl語(yǔ)言解釋器、編輯器安裝

  4.Perl運(yùn)行環(huán)境測(cè)試與程序編寫

  5.UltraEdit軟件應(yīng)用與生物信息學(xué)數(shù)據(jù)文件處理

  6.基于宏的perl語(yǔ)言快速編程

  操作基礎(chǔ)

  7.Perl語(yǔ)言基本變量、操作符、判斷結(jié)構(gòu);循環(huán)結(jié)構(gòu)

  8.Perl語(yǔ)言常用函數(shù)的功能應(yīng)用

  9.生物學(xué)數(shù)據(jù)文件的讀入與輸出

  10.生物信息學(xué)常見(jiàn)文件的分割、合并、過(guò)濾、信息提取等

  11.批量自動(dòng)化數(shù)據(jù)文件操作

  生物信息實(shí)例應(yīng)用

  12.常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)文件格式簡(jiǎn)介

  13.用perl從NCBI、ENA等數(shù)據(jù)庫(kù)批量下載基因序列

  14.用perl進(jìn)行生物學(xué)數(shù)據(jù)文件格式轉(zhuǎn)化

  15.用perl編程從Fasta、GBK、Fastq、PDB等提取關(guān)鍵生物學(xué)數(shù)據(jù)信息

  16.用perl批量自動(dòng)化下載基因序列

  17.用perl進(jìn)行DNA到protein批量翻譯

  18.用perl批量DNA序列反向互補(bǔ)

  高級(jí)數(shù)據(jù)處理

  19.Perl語(yǔ)言的數(shù)組、二維數(shù)組、hash表用法

  20.用perl自動(dòng)化從表格數(shù)據(jù)提取信息

  21.矩陣數(shù)據(jù)文件的生成與應(yīng)用

  22.二代測(cè)序NGS、GWAS等生物信息分析中perl的應(yīng)用

  模塊與子程序

  23.perl子程序與模塊應(yīng)用

  24.強(qiáng)大的正則表達(dá)式的應(yīng)用

  25.用perl進(jìn)行基因ID列表比較、篩選與統(tǒng)計(jì)

  Perl的高級(jí)應(yīng)用

  26.Perl第三方代碼庫(kù)CPAN的簡(jiǎn)介與應(yīng)用

  27.Bioperl模塊與應(yīng)用

  28.常用生物信息學(xué)程序?qū)嵗?/p>

  29.用perl進(jìn)行批量自動(dòng)化本地blast比對(duì)及數(shù)據(jù)分析

  30.多序列自動(dòng)化比對(duì)與系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建

  31.基于perl的circos基因組作圖工具介紹

  聯(lián)系方式

  聯(lián)系人:活動(dòng)家

  手機(jī)/微信號(hào):18117219833

  報(bào)名可致電:028-69761252

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