| 會(huì)議日期 | 2017-12-14至 2017-12-18 |
| 會(huì)議地點(diǎn) | 湖北武漢 |
| 會(huì)議學(xué)科 | 科研/教育 |
| 主辦單位 | 北京中科云暢應(yīng)用技術(shù)研究院 |
| 學(xué)分情況 | 無(wú) |
| 章節(jié) | 內(nèi) 容 |
| 生物信息學(xué)介紹 | 生物信息學(xué)介紹與前沿技術(shù)動(dòng)態(tài) |
| 序列的比對(duì) | 1、全局比對(duì) Clustalw,Muscle,Hmmer 2、局部比對(duì) Blast, Sim4,Genewise 3、序列比對(duì)算法分析 |
基因組/基因注釋分析 |
1、新一代測(cè)序技術(shù)原理和數(shù)據(jù)處理介紹 2、基因組拼接與組裝 基因組de novo組裝方法 重復(fù)序列分析技術(shù) 3、RNA分析 tRNA,rRNA,microRNA,snoRNA RNA干擾，SiRNA預(yù)測(cè)技術(shù) 4、基因預(yù)測(cè) 原核：Glimmer，真核：Genescan, Augustus 5、 基因功能注釋及常用的數(shù)據(jù)庫(kù)介紹 |
| 基因組學(xué)研究概述 |
1、structural genomics: 結(jié)構(gòu)基因組學(xué) 2、functional genomics: 功能基因組學(xué) 3、Drug discovery: 藥物研發(fā) 4、Personalized medicine：個(gè)性化、精細(xì)醫(yī)療 |
| DNA測(cè)序技術(shù)-轉(zhuǎn)錄組分析的進(jìn)化 | 1、第一代測(cè)序技術(shù)：Sanger測(cè)序原理 2、第二代測(cè)序技術(shù)：Illumina，454, Ion Torrent原理 3、第三代測(cè)序技術(shù)：PacBio, Hellicos原理 4、第四代測(cè)序技術(shù): Oxford NanoPore原理 5、其他技術(shù)Hybridization based methods （NabSys） |
| Experimental procedure for transcriptomic analysis | Introduction Number of duplications Sequencing coverage Transcriptomic analysis using NGS （RNA-Seq） Transcriptomic analysis using PacBio （Iso-Seq） IsoSeq Experimental design |
| Data analysis （part 1）：data pre-processing |
evaluation of data quality 數(shù)據(jù)分析 Data format，fasta，fastq，quality value，gff3 Data cleanup Quality filter, trimmer, clipper |
| Data analysis （part 2）：reference free analyses（無(wú)參轉(zhuǎn)錄組分析） | Gene discovery Trinity de novo transcriptome assembly Analysis of Differential Expressed Gene （DEGs） Abundance estimation using RSEM Differential expression analysis using EdgeR Explore the results （cummerbund） MA plot, Volcano plot, False Discovery Rate （FDR） hierarchical two-way clustering, pairwise sample-distance, gene expression profiles. |
| 使用R語(yǔ)言進(jìn)行生物信息學(xué)相關(guān)的分析 | 使用R語(yǔ)言相關(guān)的包對(duì)轉(zhuǎn)錄組等組學(xué)的高通量測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行差異表達(dá)、富集分析等。 生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)圖KEGG、GO等的繪制方法與運(yùn)用R語(yǔ)言進(jìn)行實(shí)現(xiàn) |
| 基因組可視化軟件circos的使用 | 使用circos繪制基因組圈圖 |
| 生物信息學(xué)專(zhuān)業(yè)常用工具及繪圖方法 | 應(yīng)用生物信息常用的工具進(jìn)行專(zhuān)業(yè)繪圖及格式轉(zhuǎn)換； 學(xué)BioEdit、WeGO等常用生物學(xué)專(zhuān)業(yè)軟件的圖表及格式轉(zhuǎn)換 |
報(bào)名辦法及費(fèi)用：
每人￥4300元（含報(bào)名費(fèi)、資料費(fèi)、培訓(xùn)費(fèi)、考試費(fèi)），住宿可統(tǒng)一安排，費(fèi)用自理。請(qǐng)各有關(guān)部門(mén)統(tǒng)一組織本地區(qū)行政、企事業(yè)單位報(bào)名參加培訓(xùn)，各單位也可直接報(bào)名參加，報(bào)名回執(zhí)表請(qǐng)傳真至?xí)⻊?wù)處。
地點(diǎn)：湖北 武漢
聯(lián)系人：李永軍
聯(lián)系電話：18513478760
郵箱：3263004853@qq.com
祝：工作順利，身體健康�。�！
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