醫(yī)學(xué)會(huì)議中心

會(huì)議日期	2017-11-27至 2017-11-30
會(huì)議地點(diǎn)	北京
會(huì)議學(xué)科	科研/教育
主辦單位	中國(guó)生物工程學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)與生物信息學(xué)專委會(huì)
學(xué)分情況	無

本次精品班將于11月27日至30日在北京舉辦，實(shí)用微生物組學(xué)信息分析精品班報(bào)名平臺(tái)活動(dòng)家。

為幫助各領(lǐng)域廣大科研人員解決從方案設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)解讀、圖表繪制、數(shù)據(jù)挖掘和文章設(shè)計(jì)各環(huán)節(jié)中遇到的問題。北京市計(jì)算中心特聘請(qǐng)XX一線項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富的科研人員精心組織了本次培訓(xùn)課程，為保證聽課質(zhì)量和教學(xué)質(zhì)量，本研討班采用小班授課方式。課程內(nèi)容針對(duì)性極強(qiáng)、上機(jī)實(shí)踐比重更達(dá)到70%，整套課程教學(xué)目的明確，從微生物組學(xué)實(shí)驗(yàn)方案的宏觀到細(xì)節(jié)再到注意事項(xiàng)的講解，為項(xiàng)目能產(chǎn)出更有效的測(cè)序數(shù)據(jù)打下堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)，上機(jī)實(shí)踐課程貫穿從測(cè)序數(shù)據(jù)下機(jī)后質(zhì)量評(píng)估、物種注釋到數(shù)據(jù)分析和結(jié)果呈現(xiàn)整個(gè)流程。誠(chéng)邀各領(lǐng)域廣大科研工作者和高校教師及研究生報(bào)名參加！

主辦單位：中國(guó)生物工程學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)與生物信息學(xué)專委會(huì)

培訓(xùn)地點(diǎn)：北京海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)3號(hào)樓，北京市計(jì)算中心三層會(huì)議室

培訓(xùn)時(shí)間：2017年11月27日-30日  （報(bào)名中） 上午：9：30 - 12：00   下午：1：30 – 5：00

會(huì)議日程

第一天

9：30-12：00

微生物組學(xué)研究概論及進(jìn)展

1、微生物組研究的發(fā)展歷史

2、微生物測(cè)序分析技術(shù)及實(shí)驗(yàn)技術(shù)原理

3、研究熱點(diǎn)分享

13：30-17：30

經(jīng)典案例分享和方案設(shè)計(jì)與文章架構(gòu)設(shè)計(jì)

1、微生物組學(xué)經(jīng)典文章回顧，未來微生物組學(xué)發(fā)展方向

2、已發(fā)表各類精品文章的經(jīng)驗(yàn)總結(jié)：包括經(jīng)典項(xiàng)目總體設(shè)計(jì)思路、遇到的困難及解決方案

3、文章寫作經(jīng)驗(yàn)分享，包括文章架構(gòu)設(shè)計(jì)、語言風(fēng)格、結(jié)果呈現(xiàn)等寫作技巧

第二天

9：00-12：00

Linux基礎(chǔ)操作

1、Linux常用命令使用和上機(jī)操作

2、Linux環(huán)境下軟件安裝

16s測(cè)序分析結(jié)果解讀

1、OUT分析

2、物種分類與豐度分析

3、Alpha多樣性分析

4、Beta多樣性分析

5、顯著性差異分析

13：30-17：30

16s數(shù)據(jù)分析

（上機(jī)）

1、質(zhì)控與數(shù)據(jù)拼接

2、OTU聚類

3、物種注釋

4、統(tǒng)計(jì)分析：（1）α多樣性分析；（2）β多樣性分析；（3）群落結(jié)構(gòu)及豐度分析；（4）進(jìn)化分析；（5）差異分析（Lefse）；（6）功能分析（picrust）。

第三天

9：00-12：00

宏基因組測(cè)序分析結(jié)果解讀

1、物種注釋分析

2、差異物種分析

3、差異基因分析

4、功能注釋分析

5、MGS分析

13：30-17：30

宏基因組數(shù)據(jù)分析（上機(jī)）

1、質(zhì)控

2、拼接組裝

3、聚類Binning：TETRA； MetaCluster； Phymm等

4、基因注釋：FragGeneScan；MetaGeneMark；MetaGeneAnnotator等

5、功能注釋：RAMMCAP；Blast等

6、統(tǒng)計(jì)分析：（1）物種分析；（2）功能分析；（3）差異分析；（4）比較分析

第四天

9：00-12：00

R的數(shù)據(jù)處理功能及統(tǒng)計(jì)應(yīng)用

1、R的安裝、運(yùn)行與使用

2、R語法介紹（R基本符號(hào)）

3、R數(shù)據(jù)處理，對(duì)R語言中常用的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)包括向量，數(shù)組，矩陣，列表，數(shù)據(jù)框等的介紹、使用方法及使用范圍

13：30-17：30

R繪圖功能在微生物組學(xué)信息分析中的應(yīng)用

1、基礎(chǔ)繪圖工具（繪圖函數(shù)、參數(shù)、畫圖面板分割及圖形的保存）

2、圖形案例實(shí)際操作

2.1散點(diǎn)圖-點(diǎn)線混合圖、并列散點(diǎn)圖、坐標(biāo)對(duì)數(shù)話

2.2條形圖-標(biāo)準(zhǔn)條形圖、推積條形圖Error Bar形圖

2.3餅圖

2.4盒形圖（箱線圖）

2.5頻率直方圖

2.6熱圖

有意參會(huì)請(qǐng)咨詢：

活動(dòng)家

028-69761252