醫(yī)學(xué)會(huì)議中心

會(huì)議日期	2017-11-06至 2017-11-10
會(huì)議地點(diǎn)	北京
會(huì)議學(xué)科	科研/教育
主辦單位	中國(guó)生物工程學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)與生物信息學(xué)專委會(huì)
學(xué)分情況	無(wú)

本次研討班將于11月6日至10日在北京舉辦，實(shí)用生物信息學(xué)研討班報(bào)名平臺(tái)活動(dòng)家。

近年來(lái)，以基因組科學(xué)為代表的研究工作和技術(shù)平臺(tái)先后獲得各項(xiàng)資助，如國(guó)家863計(jì)劃、973計(jì)劃、中國(guó)科學(xué)院知識(shí)創(chuàng)新工程、國(guó)家重大攻關(guān)項(xiàng)目、自然科學(xué)基金，等。為了輔助廣大科研工作者掌握高通量測(cè)序技術(shù)原理、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)以及后期數(shù)據(jù)分析技能，北京市計(jì)算中心生物計(jì)算事業(yè)部與軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所生物信息學(xué)研究室聯(lián)合舉辦“實(shí)用生物信息學(xué)”培訓(xùn)研習(xí)班。

主辦單位： 中國(guó)生物工程學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)與生物信息學(xué)專委會(huì)

北京海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)3號(hào)樓，北京市計(jì)算中心三層會(huì)議室

2017.11.6-10 上午：9：30-12：00下午：13：00-16：30

授課教師：來(lái)自計(jì)算中心、軍科院，多個(gè)海歸博士，均在生物信息學(xué)領(lǐng)域有豐富的工作經(jīng)驗(yàn)。

實(shí)際實(shí)用：理論講授和上機(jī)實(shí)習(xí)搭配，結(jié)合具體案例。

精致小班：每班少于35人，可根據(jù)學(xué)員課前提出的工作需求調(diào)整課程內(nèi)容。

VIP待遇：培訓(xùn)后，仍可免費(fèi)來(lái)我中心與生物信息專家一對(duì)一輔導(dǎo)。

效果保障：至今已經(jīng)成功舉辦多次生物信息分析專題培訓(xùn)，累計(jì)百余人次，廣受學(xué)員好評(píng)。

會(huì)議日程：

第一天

生物信息學(xué)導(dǎo)論

1.生物信息學(xué)發(fā)展簡(jiǎn)史（重點(diǎn)講解）

2.生物信息學(xué)主要研究領(lǐng)域（重點(diǎn)講解）

3.生物信息學(xué)軟件和工具

4.生物信息學(xué)重要會(huì)議

生物信息學(xué)基礎(chǔ)（上機(jī)操作）

1、linux基礎(chǔ)

掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點(diǎn)）

掌握l(shuí)inux環(huán)境下軟件的安裝使用

了解shell腳本的編寫

2、perl基礎(chǔ)

介紹Perl 的基本元素

Perl在生物信息中應(yīng)用示例（DNA復(fù)制、DNA轉(zhuǎn)錄、RNA翻譯）

第二天

二代測(cè)序技術(shù)原理及基因組拼接

1、介紹目前主流二代測(cè)序儀的測(cè)序原理

2、主要操作流程及特點(diǎn)

3、序列拼接的技術(shù)方法

4、常用軟件及全基因組個(gè)性化組裝的技巧

基因組拼接組裝（以細(xì)菌/病毒為例）（上機(jī)操作）

1、全基因組組裝的流程介紹

2、原始測(cè)序數(shù)據(jù)的預(yù)處理

3、分別介紹Velvet和SOAPdenovo的使用，并以一株細(xì)菌的測(cè)序數(shù)據(jù)為例進(jìn)行組裝

4、介紹Newbler的是使用，并以一個(gè)IonTorrent測(cè)序的噬菌體數(shù)據(jù)為例進(jìn)行組裝

5、以細(xì)菌的數(shù)據(jù)為例，介紹填補(bǔ)gap的方法，包括延伸法，局部拼接法

第三天

基因組重測(cè)序與數(shù)據(jù)分析

1、講解基因組重測(cè)序的概念、目的與應(yīng)用

2、結(jié)合實(shí)例講解其原理、類據(jù)類型與格式、操作流程、軟件等相關(guān)知識(shí)

基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)分析實(shí)例（上機(jī)操作）

1、對(duì)二代測(cè)序數(shù)據(jù)的解讀

2、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制及數(shù)據(jù)過濾

3、使用BWA和Samtools進(jìn)行數(shù)據(jù)比對(duì)并對(duì)比對(duì)結(jié)果進(jìn)行可視化（重點(diǎn)講解）

4、尋找SNP和Indel并進(jìn)行注釋（重點(diǎn)講解）

5、尋找結(jié)構(gòu)變異并對(duì)變異進(jìn)行注釋（重點(diǎn)講解）

第四天

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與數(shù)據(jù)分析

1、轉(zhuǎn)錄組基本概況和技術(shù)發(fā)展簡(jiǎn)介

2、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程及技術(shù)細(xì)節(jié)（重點(diǎn)講解）

3、轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例

轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實(shí)例（上機(jī)操作）

1、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹及安裝

2、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對(duì)（重點(diǎn)講解）

3、表達(dá)量估計(jì)和分析（重點(diǎn)講解）

4、后續(xù)功能分析簡(jiǎn)介

第五天

microRNA測(cè)序與數(shù)據(jù)分析

1、microRNA目前的應(yīng)用、發(fā)展歷史以及microRNA的定義

2、microRNA的生物學(xué)過程（重點(diǎn)講解）

3、microRNA的測(cè)序（重點(diǎn)講解）

4、microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析軟件（重點(diǎn)講解）

5、microRNA目前的挑戰(zhàn)以及將來(lái)的研究前景

6、microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析案例展示（重點(diǎn)講解）

7、近期文獻(xiàn)

microRNA數(shù)據(jù)分析實(shí)例（上機(jī)操作）

1、microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)處理（重點(diǎn)講解）

2、測(cè)序數(shù)據(jù)長(zhǎng)度分布計(jì)算

3、microRNA的預(yù)測(cè)（重點(diǎn)講解）

4、microRNA堿基偏好性計(jì)算

5、microRNA靶標(biāo)基因預(yù)測(cè)，結(jié)果提取、統(tǒng)計(jì)（重點(diǎn)講解）

蛋白結(jié)構(gòu)與互作分析

PyMol，Cytoscape

有意參會(huì)請(qǐng)咨詢：

活動(dòng)家

028-69761252