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發(fā)布醫(yī)學(xué)會(huì)議通知

轉(zhuǎn)錄組專題培訓(xùn)

會(huì)議日期 2014-08-06至 2014-08-08
會(huì)議地點(diǎn) 北京海淀區(qū)
會(huì)議學(xué)科 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)其他
主辦單位 中國(guó)生物工程雜志
學(xué)分情況 無(wú)

    近年來(lái)，隨著高通量測(cè)序技術(shù)的迅猛發(fā)展，轉(zhuǎn)錄組研究從以前的微陣列技術(shù)，SAGE及MPSS技術(shù)的低通量模式切換至RNA-seq的高通量模式。轉(zhuǎn)錄組學(xué)作為一個(gè)伴隨高通量測(cè)序技術(shù)率先發(fā)展起來(lái)的技術(shù)開始在生物學(xué)前沿研究中得到了廣泛的應(yīng)用。RNA-seq對(duì)于真核生物的基因表達(dá)調(diào)控，癌癥等疾病的發(fā)生機(jī)制和新治療方案確定，遺傳育種等眾多方面的研究具有不可估量的潛力。為了輔助廣大科研工作者掌握轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序技術(shù)原理、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)以及后期數(shù)據(jù)分析技能，北京市計(jì)算中心生物計(jì)算事業(yè)部舉辦“轉(zhuǎn)錄組學(xué)”培訓(xùn)研習(xí)班。

    主辦單位：北京市計(jì)算中心中國(guó)生物工程雜志

    培訓(xùn)地點(diǎn)：北京海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)3號(hào)樓，北京市計(jì)算中心三層會(huì)議室

    培訓(xùn)時(shí)間：第二期2014年5月8-10日（已結(jié)束）

    第三期2014年8月6日-8日（報(bào)名中）

    本次課程時(shí)間：上午：9：30-11：30下午：13：30-16：30

日期 授課題目 授課內(nèi)容
第一天 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與數(shù)據(jù)分析
  1. 轉(zhuǎn)錄組基本概況和技術(shù)發(fā)展簡(jiǎn)介
  2. 轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程及技術(shù)細(xì)節(jié)（重點(diǎn)講解）
3、轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實(shí)例（上機(jī)操作） 1、linux基礎(chǔ)
掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點(diǎn)）
掌握l(shuí)inux環(huán)境下軟件的安裝使用
了解shell腳本的編寫
2、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹
  1. 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對(duì)（重點(diǎn)講解）
表達(dá)量估計(jì)和分析（重點(diǎn)講解）
第二天 轉(zhuǎn)錄組組拼接及功能注釋
  1. 轉(zhuǎn)錄組序列拼接的技術(shù)方法
  2. 常用軟件及轉(zhuǎn)錄組個(gè)性化組裝的技巧
  3. 使用R語(yǔ)言相關(guān)的軟件包對(duì)轉(zhuǎn)錄組學(xué)的高通量測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。講解差異表達(dá)分析，GO分析，Pathway分析，聚類分析等。
講解如何繪制表達(dá)量的熱圖等
轉(zhuǎn)錄組拼接組裝（上機(jī)操作） 1、轉(zhuǎn)錄組組裝的流程介紹
2、原始測(cè)序數(shù)據(jù)的預(yù)處理
3、介紹Trinity的使用，并以測(cè)試測(cè)序數(shù)據(jù)為例進(jìn)行組裝
4、介紹cdhit的是使用，并以測(cè)試組裝結(jié)果為例進(jìn)行聚類
5、介紹尋找ORF的方法
第三天 microRNA測(cè)序與數(shù)據(jù)分析
  1. microRNA目前的應(yīng)用、發(fā)展歷史以及microRNA的定義
  2. microRNA的生物學(xué)過(guò)程（重點(diǎn)講解）
  3. microRNA的測(cè)序（重點(diǎn)講解）
  4. microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析軟件（重點(diǎn)講解）
  5. microRNA目前的挑戰(zhàn)以及將來(lái)的研究前景
  6. microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析案例展示（重點(diǎn)講解）
近期文獻(xiàn)
microRNA數(shù)據(jù)分析實(shí)例（上機(jī)操作）
  1. microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)處理（重點(diǎn)講解）
  2. 測(cè)序數(shù)據(jù)長(zhǎng)度分布計(jì)算
  3. microRNA的預(yù)測(cè)（重點(diǎn)講解）
  4. microRNA堿基偏好性計(jì)算
microRNA靶標(biāo)基因預(yù)測(cè)，結(jié)果提取、統(tǒng)計(jì)（重點(diǎn)講解）


    注：參加培訓(xùn)班的學(xué)員投稿《中國(guó)生物工程雜志》，通過(guò)審稿的論文將會(huì)優(yōu)先發(fā)表。

    【報(bào)名費(fèi)用】

    注冊(cè)費(fèi)：工作人員3000元/人、學(xué)生2500元/人（含聽課費(fèi)、資料費(fèi)、上機(jī)費(fèi)，請(qǐng)自帶筆記本電腦以備上機(jī)實(shí)踐使用），主辦方可協(xié)助安排入住酒店，住宿費(fèi)用自理。

    【付費(fèi)方式】現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款

    單位全稱：北京市計(jì)算中心      賬號(hào)：0200151819100023937

    開戶銀行：中國(guó)工商銀行股份有限公司北京永豐支行

    （匯款信息里 備注上：“生物計(jì)算事業(yè)部-您的姓名”，個(gè)人匯款請(qǐng)備注單位名稱）

    【報(bào)名優(yōu)惠政策】

    1、7.1日前預(yù)報(bào)名的學(xué)員每人可優(yōu)惠400元，

    開課前10天報(bào)名的學(xué)員每人可減少100元。

    2、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少400元；

    3、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額

    4、上面4種優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種。

    培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報(bào)名，培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。

    報(bào)名截止：2014年8月5日

    請(qǐng)聯(lián)系：張老師 010-59341771 ，18618295767，QQ號(hào)：2814500767，郵箱zhangly@bcc.ac.cn

    員老師   010-59341773，  18701529461 ，   郵箱：yuanll@bcc.ac

    網(wǎng)址：bioc.bcc.ac.cn

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