會(huì)議日期 | 2014-09-01至 2014-09-04 |
會(huì)議地點(diǎn) | 北京海淀區(qū) |
會(huì)議學(xué)科 | 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)其他 |
主辦單位 | 北京市計(jì)算中心,生物計(jì)算事業(yè)部 |
學(xué)分情況 | 無(wú) |
Perl語(yǔ)言作為絕大多數(shù)生物信息學(xué)工作者首選語(yǔ)言之一。北京市計(jì)算中心生物計(jì)算事業(yè)部針對(duì)沒(méi)有任何計(jì)算機(jī)語(yǔ)言的生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)等人員,且有從事生物信息學(xué)工作相關(guān)研究工作的需要。歡迎您報(bào)名參加!
主辦單位:北京市計(jì)算中心,生物計(jì)算事業(yè)部
舉辦地:北京,北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓
培訓(xùn)時(shí)間:第五期2014年4月8日-11日 (已結(jié)束)
第六期2014年9月1日-4日 (報(bào)名中)
報(bào)名截止:2014年8月31日
培訓(xùn)內(nèi)容及安排: 注:高級(jí)內(nèi)容調(diào)整中
日期 | 時(shí)間 | 授課題目 | 授課內(nèi)容 |
第一天 | 09:30-10:00 | 生物信息學(xué)與Perl語(yǔ)言概述 | 概括介紹生物信息學(xué)背景與Perl語(yǔ)言的概念及特點(diǎn) |
10:00-10:20 | 軟件安裝與運(yùn)行環(huán)境調(diào)試 | Perl語(yǔ)言解釋器、編輯器安裝,Perl程序運(yùn)行測(cè)試 | |
10:20-12:00 | 基本操作與基本概念 | DOS、Unix命令行操作基本命令;Perl語(yǔ)言基本變量與操作符 | |
13:30-16:00 | 基本變量 | 變量、字符串賦值、基本運(yùn)算等練習(xí) | |
第二天 | 09:30-12:00 | 基本語(yǔ)法結(jié)構(gòu) | 判斷結(jié)構(gòu);循環(huán)結(jié)構(gòu);練習(xí) |
13:30-16:00 | 數(shù)組及應(yīng)用 | 數(shù)組的概念及用法;練習(xí) | |
第三天 | 09:30-11:00 | 文件與文件夾操作 | 文件的讀入與輸入;文件夾操作;練習(xí) |
11:00-12:00 | 二維數(shù)組與hash表及應(yīng)用 | 二維數(shù)組概念、關(guān)聯(lián)數(shù)組(hash表)概念及用法;練習(xí) | |
13:30-16:00 | 常用函數(shù)及子程序 | 常用Perl語(yǔ)言基礎(chǔ)函數(shù)學(xué)習(xí);子程序概念與應(yīng)用;練習(xí) | |
第四天 | 09:30-12:00 | 正則表達(dá)式及生物信息學(xué)Perl程序?qū)嵗?/td> | Perl特色功能正則表達(dá)式學(xué)習(xí)與應(yīng)用;生物信息學(xué)實(shí)例程序?qū)W習(xí);練習(xí) |
13:30-16:00 | Bioperl簡(jiǎn)介、CPAN簡(jiǎn)介、常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與軟件簡(jiǎn)介 | Bioperl簡(jiǎn)介與安裝;Perl第三方代碼庫(kù)CPAN簡(jiǎn)介;常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介、數(shù)據(jù)類型與應(yīng)用;常用生物信息學(xué)軟件數(shù)據(jù)格式及軟件應(yīng)用簡(jiǎn)介 | |
授課實(shí)例 | 1、生物學(xué)數(shù)據(jù)文件批量的合并、分隔、去冗余等。 2、生物信息序列數(shù)據(jù)fastq、fasta、genbank文件等格式轉(zhuǎn)換與批量自動(dòng)化處理。 3、按個(gè)性化實(shí)驗(yàn)需求,從生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)文件(如genbank、EMBL)中批量自動(dòng)化提取特定數(shù)據(jù)信息。 4、表格矩陣型數(shù)據(jù)的行列轉(zhuǎn)換、特定數(shù)據(jù)信息的自動(dòng)化過(guò)濾與數(shù)據(jù)篩選等。 5、二代測(cè)序原始數(shù)據(jù)的批量過(guò)濾處理,如barcode識(shí)別、質(zhì)量值過(guò)濾等。 6、基因、蛋白質(zhì)序列特定位點(diǎn)的識(shí)別,如起始、終止位點(diǎn)、ORF、motif、CDS等。 7、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)序列特征提取與自動(dòng)化統(tǒng)計(jì),如GC百分含量、k-mer統(tǒng)計(jì)、基因反向互補(bǔ)轉(zhuǎn)換等。 8、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)文件的批量自動(dòng)化下載與信息提。ㄟx學(xué))。 |
培訓(xùn)班類型:(可多選) | □實(shí)用生物信息學(xué)培訓(xùn)班 □論文發(fā)表所需的圖表處理實(shí)用技能 □生物信息與宏基因組分析專題研討班 □Perl語(yǔ)言專題班 □實(shí)用生物信息技術(shù)及應(yīng)用(羅靜初教授主講) |
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姓名: | 性別 | 民族: | 職稱: | ||||||||||||||
身份證號(hào) | |||||||||||||||||
工作單位: | 住宿: | 是□;否□ | |||||||||||||||
研究方向: | 報(bào)名時(shí)間: | ||||||||||||||||
通訊地址: | 郵編: | ||||||||||||||||
固定電話: | 手機(jī): | E-mail: | |||||||||||||||
報(bào)名種類: | A□ B□ (該選項(xiàng)僅報(bào)名生物信息培訓(xùn)班人員填寫) | ||||||||||||||||
對(duì)課程了解情況 | ☆☆☆☆☆ | 感興趣的課程: | |||||||||||||||
信息渠道: | □中心主頁(yè) □郵件宣傳(張利英、員麗麗)□海報(bào) □單頁(yè) □銷售員 □丁香園 □生物論壇 □生物通郵件、主頁(yè) □朋友推薦 | ||||||||||||||||
發(fā)票抬頭: | 發(fā)票內(nèi)容: | ||||||||||||||||
住宿明細(xì) | 入住時(shí)間: 離店時(shí)間: |
房間類型 | □大床間 □標(biāo)準(zhǔn)間(和 合。 □拼房(與其他學(xué)員拼標(biāo)準(zhǔn)間) |
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備注: |
確定報(bào)名后,請(qǐng)將回執(zhí)表發(fā)到上述聯(lián)系人郵箱里。如在兩日內(nèi)沒(méi)有收到回復(fù),請(qǐng)電話聯(lián)系確認(rèn)。
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