醫(yī)學(xué)會(huì)議中心

發(fā)布醫(yī)學(xué)會(huì)議通知

Perl語(yǔ)言基礎(chǔ)與生物信息學(xué)應(yīng)用講習(xí)班

會(huì)議日期 2014-09-01至 2014-09-04
會(huì)議地點(diǎn) 北京海淀區(qū)
會(huì)議學(xué)科 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)其他
主辦單位 北京市計(jì)算中心,生物計(jì)算事業(yè)部
學(xué)分情況 無(wú)

    Perl語(yǔ)言作為絕大多數(shù)生物信息學(xué)工作者首選語(yǔ)言之一。北京市計(jì)算中心生物計(jì)算事業(yè)部針對(duì)沒(méi)有任何計(jì)算機(jī)語(yǔ)言的生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)等人員,且有從事生物信息學(xué)工作相關(guān)研究工作的需要。歡迎您報(bào)名參加!

    主辦單位:北京市計(jì)算中心,生物計(jì)算事業(yè)部

    舉辦地:北京,北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓

    培訓(xùn)時(shí)間:第五期2014年4月8日-11日 (已結(jié)束)

    第六期2014年9月1日-4日 (報(bào)名中)

    報(bào)名截止:2014年8月31日

    培訓(xùn)內(nèi)容及安排:  注:高級(jí)內(nèi)容調(diào)整中

日期 時(shí)間 授課題目 授課內(nèi)容
第一天 09:30-10:00 生物信息學(xué)與Perl語(yǔ)言概述 概括介紹生物信息學(xué)背景與Perl語(yǔ)言的概念及特點(diǎn)
10:00-10:20 軟件安裝與運(yùn)行環(huán)境調(diào)試 Perl語(yǔ)言解釋器、編輯器安裝,Perl程序運(yùn)行測(cè)試
10:20-12:00 基本操作與基本概念 DOS、Unix命令行操作基本命令;Perl語(yǔ)言基本變量與操作符
13:30-16:00 基本變量 變量、字符串賦值、基本運(yùn)算等練習(xí)
第二天 09:30-12:00 基本語(yǔ)法結(jié)構(gòu) 判斷結(jié)構(gòu);循環(huán)結(jié)構(gòu);練習(xí)
13:30-16:00 數(shù)組及應(yīng)用 數(shù)組的概念及用法;練習(xí)
第三天 09:30-11:00 文件與文件夾操作 文件的讀入與輸入;文件夾操作;練習(xí)
11:00-12:00 二維數(shù)組與hash表及應(yīng)用 二維數(shù)組概念、關(guān)聯(lián)數(shù)組(hash表)概念及用法;練習(xí)
13:30-16:00 常用函數(shù)及子程序 常用Perl語(yǔ)言基礎(chǔ)函數(shù)學(xué)習(xí);子程序概念與應(yīng)用;練習(xí)
第四天 09:30-12:00 正則表達(dá)式及生物信息學(xué)Perl程序?qū)嵗?/td> Perl特色功能正則表達(dá)式學(xué)習(xí)與應(yīng)用;生物信息學(xué)實(shí)例程序?qū)W習(xí);練習(xí)
13:30-16:00 Bioperl簡(jiǎn)介、CPAN簡(jiǎn)介、常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與軟件簡(jiǎn)介 Bioperl簡(jiǎn)介與安裝;Perl第三方代碼庫(kù)CPAN簡(jiǎn)介;常用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介、數(shù)據(jù)類型與應(yīng)用;常用生物信息學(xué)軟件數(shù)據(jù)格式及軟件應(yīng)用簡(jiǎn)介
授課實(shí)例 1、生物學(xué)數(shù)據(jù)文件批量的合并、分隔、去冗余等。
2、生物信息序列數(shù)據(jù)fastq、fasta、genbank文件等格式轉(zhuǎn)換與批量自動(dòng)化處理。
3、按個(gè)性化實(shí)驗(yàn)需求,從生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)文件(如genbank、EMBL)中批量自動(dòng)化提取特定數(shù)據(jù)信息。
4、表格矩陣型數(shù)據(jù)的行列轉(zhuǎn)換、特定數(shù)據(jù)信息的自動(dòng)化過(guò)濾與數(shù)據(jù)篩選等。
5、二代測(cè)序原始數(shù)據(jù)的批量過(guò)濾處理,如barcode識(shí)別、質(zhì)量值過(guò)濾等。
6、基因、蛋白質(zhì)序列特定位點(diǎn)的識(shí)別,如起始、終止位點(diǎn)、ORF、motif、CDS等。
7、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)序列特征提取與自動(dòng)化統(tǒng)計(jì),如GC百分含量、k-mer統(tǒng)計(jì)、基因反向互補(bǔ)轉(zhuǎn)換等。
8、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)文件的批量自動(dòng)化下載與信息提。ㄟx學(xué))。

    (此表僅供參考,授課內(nèi)容以實(shí)際授課為準(zhǔn))

    注:參加培訓(xùn)班的學(xué)員投稿《中國(guó)生物工程雜志》,通過(guò)審稿的論文將會(huì)優(yōu)先發(fā)表。

    【培訓(xùn)特色】

    1、對(duì)口生物信息;    2、非嚴(yán)格語(yǔ)法,適合初學(xué);

    3、功能強(qiáng)大、跨平臺(tái);4、有巨大的第三方代碼庫(kù)CPAN

    【報(bào)名費(fèi)用】  注冊(cè)費(fèi):2800元/人(含聽(tīng)課費(fèi)、資料費(fèi)、上機(jī)費(fèi)、午餐,請(qǐng)自帶筆記本電腦以備上機(jī)實(shí)踐使用),主辦方可協(xié)助安排入住酒店,住宿費(fèi)用自理。

    【付費(fèi)方式】現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款

    單位全稱:北京市計(jì)算中心      賬號(hào):0200151819100023937

    開(kāi)戶銀行:中國(guó)工商銀行股份有限公司北京永豐支行

    (匯款信息里 備注上:“生物計(jì)算事業(yè)部-您的姓名”)

    【報(bào)名優(yōu)惠政策】

    1、2014年8月1日前報(bào)名繳費(fèi),可享受減免400元優(yōu)惠。8.18日前報(bào)名繳費(fèi)優(yōu)惠100元。

    2、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少400元;

    3、4+1團(tuán)報(bào),可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額

    4、上面3種優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受,只能享受其中一種。

    培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報(bào)名,培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。

    【聯(lián)系咨詢】

    張利英 010-59341771 ,18618295767,QQ號(hào):2814500767,郵箱:zhangly@bcc.ac.cn

    員麗麗 010-59341773, 18701529461 ,  郵箱:yuanll@bcc.ac.cn

    報(bào)名回執(zhí)表:


培訓(xùn)班類型:(可多選) □實(shí)用生物信息學(xué)培訓(xùn)班 □論文發(fā)表所需的圖表處理實(shí)用技能
生物信息與宏基因組分析專題研討班 □Perl語(yǔ)言專題班
□實(shí)用生物信息技術(shù)及應(yīng)用(羅靜初教授主講)
姓名:   性別   民族:   職稱:  
身份證號(hào)  
工作單位:   住宿: 是□;否□
研究方向:   報(bào)名時(shí)間:  
通訊地址:   郵編:  
固定電話:   手機(jī)   E-mail:  
報(bào)名種類: A□ B□ (該選項(xiàng)僅報(bào)名生物信息培訓(xùn)班人員填寫)
對(duì)課程了解情況 ☆☆☆☆☆ 感興趣的課程:  
信息渠道: □中心主頁(yè) □郵件宣傳(張利英、員麗麗)□海報(bào) □單頁(yè) □銷售員 □丁香園 □生物論壇 □生物通郵件、主頁(yè) □朋友推薦
發(fā)票抬頭:   發(fā)票內(nèi)容:  
住宿明細(xì) 入住時(shí)間:
離店時(shí)間:
房間類型 □大床間
□標(biāo)準(zhǔn)間(和 合。
□拼房(與其他學(xué)員拼標(biāo)準(zhǔn)間)
備注:  


    確定報(bào)名后,請(qǐng)將回執(zhí)表發(fā)到上述聯(lián)系人郵箱里。如在兩日內(nèi)沒(méi)有收到回復(fù),請(qǐng)電話聯(lián)系確認(rèn)。

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