| 會(huì)議日期 | 2018-07-20至 2018-07-24 |
| 會(huì)議地點(diǎn) | 云南昆明 |
| 會(huì)議學(xué)科 | 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)分子生物 |
| 主辦單位 | 北京中科云暢應(yīng)用技術(shù)研究院 |
| 學(xué)分情況 | 無 |
1、系統(tǒng)介紹科研項(xiàng)目如何從大思路著眼進(jìn)行海量數(shù)據(jù)挖掘；
2、結(jié)合各大項(xiàng)目實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)，詳細(xì)介紹多種數(shù)據(jù)分析軟件的使用方法；
3、經(jīng)典項(xiàng)目總體設(shè)計(jì)思路、遇到的困難及解決方案；
4、理論課與實(shí)踐課相結(jié)合，講師與學(xué)員研討的方式進(jìn)行；
5、精心挑選相應(yīng)的上機(jī)軟件，為每位學(xué)員提供實(shí)際操作的機(jī)會(huì)；
6、課下主講老師為您所遇到的瓶頸問題提供個(gè)性化解答。
| 章節(jié) | 內(nèi)容 | ||
7.21 第一天 |
生物信息學(xué)介紹 | 生物信息學(xué)介紹與前沿技術(shù)動(dòng)態(tài) | 3900元/人 |
| 新物種基因組測(cè)序策略及基因組文章構(gòu)成分析 | 1、新物種的基因組測(cè)序的意義 2、基因組從頭測(cè)序技術(shù)路線 3、數(shù)據(jù)獲得與處理 4、基因組基本分析 |
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| 新物種基因組測(cè)序策略及基因組文章構(gòu)成分析 | 1、轉(zhuǎn)錄組基本分析 2、基因組比較分析 3、數(shù)據(jù)挖掘與生物功能 4、基因組文章構(gòu)思的關(guān)鍵基本共識(shí) |
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| 微生物基因組學(xué) |
1、微生物基因組研究概況 2、微生物基因組的特點(diǎn) 3微生物基因組研究的意義 4、原核生物轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究 5、單個(gè)基因組分析流程 6、泛基因組分析流程 宏基因組/宏轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用 |
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| 7.22 第二天 |
Linux命令簡(jiǎn)介 | 1、Linux背景介紹 2、常用命令 3、權(quán)限管理 4、進(jìn)程查看等 |
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| R語言基礎(chǔ)以及ggplot2繪圖 | 1、R語言基本介紹 2、R語言基本運(yùn)算、向量函數(shù) 3、R語言數(shù)據(jù)讀入以及導(dǎo)出 4、ggplot2基本繪圖（條形圖、散點(diǎn)圖、折線圖等） |
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| 7.23 第三天 |
使用R語言進(jìn)行生物信息學(xué)相關(guān)的分析 |
1、高通量測(cè)序RNA-seq數(shù)據(jù)的格式、質(zhì)量值計(jì)算、優(yōu)缺點(diǎn) 2、無參考基因組-數(shù)據(jù)拼接軟件介紹 3、表達(dá)量計(jì)算軟件介紹 上機(jī)操作實(shí)習(xí)： （i）利用bioconductor包EdgeR進(jìn)行差異基因分析 （ii）利用bioconductor包degeR進(jìn)行差異基因分析 （iii）利用熱圖進(jìn)行聚類分析 （iv）GO、KEGG等功能聚類分析及用perl語言實(shí)現(xiàn) BioEdit、WEGO等常用生物軟件介紹 |
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| 7.24 第四天 |
生物信息學(xué)專業(yè)常用工具及繪圖方法 | 1、利用fastQC進(jìn)行質(zhì)量評(píng)估 2、BLAST簡(jiǎn)單介紹 3、微生物基因組圈圖（CGview,OGdraw） 4、功能注釋（KEGG（KAAS），Islandviewer，ARDB） 5、進(jìn)化樹分析（模型評(píng)估，進(jìn)化樹構(gòu)建，注釋）MEGA 6、泛基因組學(xué)分析（PanGP） |
900元/人 |
| 生物信息學(xué)專業(yè)常用工具及繪圖方法 | 1、Perl語言入門 2、基因組大小評(píng)估 3、基因組拼接質(zhì)量評(píng)估 （i）N50統(tǒng)計(jì) （ii）根據(jù)比對(duì)結(jié)果統(tǒng)計(jì)深度和覆蓋度 （iii）堿基GC含量等信息統(tǒng)計(jì) 4、基因結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果展示和提取 （i）GFF文件介紹 （ii）GFF內(nèi)容提取 5、使用circos繪制基因組圈圖 |
中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所基因組科學(xué)與信息重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室胡松年老師，擁有豐富的科研及工程技術(shù)經(jīng)驗(yàn)，長(zhǎng)期從事生物信息領(lǐng)域項(xiàng)目研究，具有資深的技術(shù)底蘊(yùn)和專業(yè)背景。
前三天課程費(fèi)用3900元/人，為必選。最后一天課程900元/人，可按照需求選擇，四天課程共4800，選擇全部課程可優(yōu)惠500元，優(yōu)惠后價(jià)格4300元（含報(bào)名費(fèi)、培訓(xùn)費(fèi)、資料費(fèi)、等相關(guān)費(fèi)用）食宿統(tǒng)一安排，費(fèi)用自理。請(qǐng)各有關(guān)部門統(tǒng)一組織本地區(qū)行政、企事業(yè)單位報(bào)名參加培訓(xùn)，各單位也可直接報(bào)名參加，報(bào)名回執(zhí)表請(qǐng)郵件回復(fù)至?xí)⻊?wù)組。*如果有計(jì)劃參加我們的學(xué)習(xí)班，報(bào)名前請(qǐng)先電話聯(lián)系張老師，謝謝！
會(huì)議負(fù)責(zé)人：張愛國(guó)老師
咨詢電話：136-8311-1214
辦公電話：010-89368120
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