醫(yī)學(xué)會議中心

會議日期	2017-12-14至 2017-12-18
會議地點(diǎn)	湖北武漢
會議學(xué)科	基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)分子生物
主辦單位	中科云暢應(yīng)用技術(shù)研究院
學(xué)分情況	無

一、培訓(xùn)目標(biāo)及特點(diǎn)：

本培訓(xùn)以第三代測序、第四代測序技術(shù)的應(yīng)用與數(shù)據(jù)分析、基因組、轉(zhuǎn)錄組為主題，精心設(shè)計(jì)了具有前沿性、實(shí)用性和針對性強(qiáng)的理論課程和上機(jī)實(shí)操課程。培訓(xùn)邀請的主講人均是有理論和實(shí)際研究經(jīng)驗(yàn)的人員，學(xué)員通過與專家直接交流能夠分享到這些頂尖學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)的研究經(jīng)驗(yàn)和實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路。學(xué)員通過集中專題學(xué)習(xí)后能夠擴(kuò)展思路，在研究技術(shù)方面領(lǐng)悟更多

生物信息學(xué)介紹 生物信息學(xué)介紹與前沿技術(shù)動態(tài)

序列的比對

1、全局比對 Clustalw，Muscle，Hmmer

2、局部比對 Blast， Sim4，Genewise

3、序列比對算法分析

基因組/基因注釋分析

1、新一代測序技術(shù)原理和數(shù)據(jù)處理介紹

2、基因組拼接與組裝

基因組 de novo 組裝方法

重復(fù)序列分析技術(shù)

3、 RNA 分析

tRNA，rRNA，microRNA，snoRNA RNA 干擾，SiRNA 預(yù)測技術(shù)

4、基因預(yù)測

原核：Glimmer，真核：Genescan， Augustus

5、 基因功能注釋及常用的數(shù)據(jù)庫介紹

基因組學(xué)研究概述

1、structural genomics： 結(jié)構(gòu)基因組學(xué)

2、functional genomics： 功能基因組學(xué)

3、Drug discovery： 藥物研發(fā)

4、Personalized medicine：個性化、精細(xì)醫(yī)療

DNA 測序技術(shù)-轉(zhuǎn)錄組分析的進(jìn)化

1、第一代測序技術(shù)：Sanger 測序原理

2、第二代測序技術(shù)：Illumina，454， Ion Torrent 原理

3、第三代測序技術(shù)：PacBio， Hellicos 原理

4、第四代測序技術(shù)： Oxford NanoPore 原理

5、其他技術(shù) Hybridization based methods （NabSys）

Experimentalprocedure fortranscriptomicanalysis

Introduction

Number of duplications

Sequencing coverage

Transcriptomic analysis using NGS （RNA-Seq）

Transcriptomic analysis using PacBio （Iso-Seq）

IsoSeq Experimental design

Data analysis （part 1）：data pre-processing

evaluation of data quality 數(shù)據(jù)分析

Data format，fasta，fastq，quality value，gff3 Data cleanup

Quality filter， trimmer， clipper

Data analysis（part2）：reference freeanalyses（無參轉(zhuǎn)錄組分析）

Gene discovery

Trinity de novo transcriptome assembly

Analysis of Differential Expressed Gene （DEGs）

Abundance estimation using RSEM

Differential expression analysis using EdgeR

Explore the results （cummerbund）

MA plot， Volcano plot， False Discovery Rate （FDR）

hierarchical two-way clustering， pairwise sample-distance， gene

expression profiles.

使用 R 語言進(jìn)行生物信息學(xué)相關(guān)的分析

使用 R 語言相關(guān)的包對轉(zhuǎn)錄組等組學(xué)的高通量測序數(shù)據(jù)進(jìn)行差異表達(dá)、富集分析等。

生物信息學(xué)專業(yè)圖 KEGG、GO 等的繪制方法與運(yùn)用 R 語言進(jìn)行實(shí)現(xiàn)

基因組可視化軟件circos 的使用

使用 circos 繪制基因組圈圖

生物信息學(xué)專業(yè)常用工具及繪圖方法

應(yīng)用生物信息常用的工具進(jìn)行專業(yè)繪圖及格式轉(zhuǎn)換；

學(xué) BioEdit、WeGO 等常用生物學(xué)專業(yè)軟件的圖表及格式轉(zhuǎn)換

主講專家：

主講專家來自中科院基因所等科研機(jī)構(gòu)的高級專家，擁有豐富的科研及工程技術(shù)經(jīng)驗(yàn)，長期從事生物信息領(lǐng)域項(xiàng)目研究，具有資深的技術(shù)底蘊(yùn)和專業(yè)背景。

報(bào)名辦法及費(fèi)用：

每人￥4300 元（含報(bào)名費(fèi)、資料費(fèi)、培訓(xùn)費(fèi)、上機(jī)費(fèi)）不含食宿，住宿可統(tǒng)一安排，費(fèi)用自理。請各有關(guān)部門統(tǒng)一組織本地區(qū)行政、企事業(yè)單位報(bào)名參加培訓(xùn)，各單位也可直接報(bào)名參加。

同一單位有5人團(tuán)報(bào)可免一人費(fèi)用

聯(lián)系人：康樂  151 3133 5232

座    機(jī)：010-58032788

郵    箱：274260631@qq.com