| 會議日期 | 2019-11-15至 2019-11-18 |
| 會議地點 | 湖北武漢 |
| 會議學科 | 基礎(chǔ)醫(yī)學病理/病生理 |
| 主辦單位 | 中科成創(chuàng)（北京）生物技術(shù)有限公司 |
| 學分情況 | 無 |
關(guān)于舉辦“單細胞測序分析及單細胞轉(zhuǎn)錄組上機實訓”通知
各有關(guān)單位:
隨著新一代單細胞測序技術(shù)的快速發(fā)展，在準確度大大提高的前提下, 進一步降低測序成本。由此不斷產(chǎn)生出巨量的分子生物學數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)有著數(shù)量巨大、關(guān)系復雜的特點，以至于不利用計算機根本無法實現(xiàn)數(shù)據(jù)的存儲和分析。隨著生物信息學作為新興學科迅速蓬勃發(fā)展，正在改變?nèi)藗冄芯可镝t(yī)學的傳統(tǒng)方式，單細胞技術(shù)以及數(shù)據(jù)分析技術(shù)已成為探索生物學底層機制和研究人類復雜疾病診斷、治療及預后的重要工具，廣泛應(yīng)用于生命科學各個領(lǐng)域，是21世紀生命科學與生物技術(shù)的重要戰(zhàn)略前沿和主要突破口。為進一步推動我國生物信息學特別是單細胞測序的發(fā)展，提高從業(yè)人員的技術(shù)水平，由中科成創(chuàng)（北京）生物技術(shù)有限公司舉辦“單細胞測序分析及單細胞轉(zhuǎn)錄組上機實訓”具體事宜通知如下：
一、培訓目標及特點：
本培訓以單細胞測序技術(shù)的應(yīng)用與數(shù)據(jù)分析、單細胞轉(zhuǎn)錄組為主題，精心設(shè)計了具有前沿性、實用性和針對性強的理論課程和上機課程。培訓邀請的主講人均是有理論和實際研究經(jīng)驗的人員。學員通過與專家直接交流，能夠分享到這些學術(shù)機構(gòu)的研究經(jīng)驗和實驗設(shè)計思路。學員通過集中專題學習后能夠擴展思路，在研究技術(shù)方面領(lǐng)悟更多。
二、培訓對象：
大中專院校生物信息、生物計算、生命科學、醫(yī)學、化學、農(nóng)學、計算機科學、數(shù)學類專業(yè)的課程負責人、一線教師、教研室骨干人員、教學管理人員；科研單位從事生物、生命科學、微生物研究的相關(guān)人員；生物、醫(yī)藥、化學及相關(guān)企業(yè)的領(lǐng)導與技術(shù)骨干。
三、時間地點： 2019年11月15日——11月18日 湖北武漢
（時間安排：第1天報到，授課3天）
四、授課專家：
主講專家來自中科院科研機構(gòu)的專家，擁有豐富的科研工作經(jīng)驗，長期從事生物信息學方面的項目研究，發(fā)表Nature, Nature Cell Biology, Molecular Cell等雜志40多篇。具有資深的技術(shù)底蘊和專業(yè)背景，目前承擔國家科技部、國家自然基金委和市科技新星項目等多項課題。
五丶培訓內(nèi)容：
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單細胞測序技術(shù)與應(yīng)用 |
1. 單細胞組學技術(shù)發(fā)展歷程和原理介紹。 2. 單細胞測序技術(shù)在科研領(lǐng)域的應(yīng)用。 3. 近年單細胞方向高分文章思路解析。 4. 單細胞組學和多組學整合分析思路和案例介紹。 |
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Linux及R語言入門與實操 |
1. 常規(guī)基礎(chǔ)Linux命令入門講解及實操訓練。 2. R語言簡介及安裝，RStudio的安裝及使用說明。 3. R語言語法介紹及常用命令。 4. 數(shù)據(jù)處理功能及統(tǒng)計應(yīng)用。 5. R語言畫圖實操。 |
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單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析思路及流程 |
1. 單細胞實驗處理、建庫及測序。 2. 單細胞轉(zhuǎn)錄組比對、定量、分群及擬時間分析等分析思路。 3. 單細胞轉(zhuǎn)錄組轉(zhuǎn)錄因子及功能通路解析。 4. 單細胞組學技術(shù)在癌癥、發(fā)育、免疫及在植物、微生物等領(lǐng)域的研究內(nèi)容及思路。 |
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單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實操 |
1. 常規(guī)單細胞組學數(shù)據(jù)比對。 2. 10X官方單細胞軟件Cellranger講解及實操。 3. 從基因表達矩陣開始到marker基因篩選全過程講解及實操。 4. 通過Seurat軟件進行PCA及tSNE降維。 5. 單細胞轉(zhuǎn)錄組細胞鑒定及聚類分析。 6. 通過Seurat及GSVA等進行單細胞轉(zhuǎn)錄組差異分析。 |
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多組學整合分析和結(jié)果解讀 |
1. 轉(zhuǎn)錄組，基因組，表觀分析介紹。 2. RNA和 ATAC-seq等多組學整合分析。 3. 常規(guī)10X單細胞ATAC數(shù)據(jù)測序原理簡介、分析流程介紹。 4. 單細胞免疫組庫測序技術(shù)及應(yīng)用。 5. 組學分析常用數(shù)據(jù)庫介紹及使用。 |
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單細胞轉(zhuǎn)錄組軌跡、通路、轉(zhuǎn)錄因子等分析及繪圖實操 |
1. 通過Monocle軟件進行單細胞轉(zhuǎn)錄組擬時間分析。 2. 通過DAVID及metascape網(wǎng)站進行通路富集分析。 3. 通過SCENIC軟件進行轉(zhuǎn)錄因子預測分析。 4. tSNE，小提琴圖，熱圖，網(wǎng)絡(luò)圖，GO、KEGG富集圖，GSEA等圖形繪制。 |
六、報名辦法及費用：
每人￥4300元（含報名費、培訓費、資料費、上機費）
團隊報名：4+1優(yōu)惠。（5位其中1位免除費用）
所報名參加學員贈送一個8G U盤（內(nèi)含上課所有使用軟件與課件資料）
食宿可統(tǒng)一安排，費用自理。各單位人員報名參加，報名回執(zhí)表請回傳至會務(wù)處即可。
如單位有內(nèi)訓需求，請將內(nèi)訓方案傳至會務(wù)組，根據(jù)單位需求安排相應(yīng)專家進行授課
七、 聯(lián)系方式：
聯(lián)系人：白嵐 138 1194 3959 報名郵箱：zkcc_BIS@vip.163.com
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