| 會議日期 | 2014-12-01至 2014-12-05 |
| 會議地點 | 北京海淀區(qū) |
| 會議學科 | 其他臨床�？粕翅t(yī)學 |
| 主辦單位 | 北京市計算中心 |
| 學分情況 | 無 |
實用生物信息學培訓班：
如您所知，近年來，以基因組科學為代表的研究工作和技術平臺先后獲得各項資助，如國家863計劃、973計劃、中國科學院知識創(chuàng)新工程、國家重大攻關項目、自然科學基金，等。為了輔助廣大科研工作者掌握高通量測序技術原理、實驗設計以及后期數(shù)據(jù)分析技能，北京市計算中心生物計算事業(yè)部與軍事醫(yī)學科學院微生物流行病研究所生物信息學研究室聯(lián)合舉辦“實用生物信息學”培訓研習班。
主辦單位：北京市計算中心。
軍事醫(yī)學科學院微生物流行病研究所生物信息學研究室。
培訓地點：北京海淀區(qū)豐賢中路7號3號樓，北京市計算中心三層會議室。
本次課程時間：2014.12.1-2014.12.5.
上午：9：30-12：00下午：13：00-16：30.
| 日期 | 授課題目 | 授課內(nèi)容 |
| 第一天 | 生物信息學導論 | 1.生物信息學發(fā)展簡史（重點講解） 2.生物信息學主要研究領域（重點講解） 3.生物信息學軟件和工具 4.生物信息學重要會議 |
| 生物信息學基礎（上機操作） | 1、linux基礎 掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點） 掌握linux環(huán)境下軟件的安裝使用 了解shell腳本的編寫 2、perl基礎 介紹Perl 的基本元素 Perl在生物信息中應用示例（DNA復制、DNA轉錄、RNA翻譯） |
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| 第二天 | 二代測序技術原理及基因組拼接 | 1、 介紹目前主流二代測序儀的測序原理 2、 主要操作流程及特點 3、 序列拼接的技術方法 4、 常用軟件及全基因組個性化組裝的技巧 |
| 基因組拼接組裝（以細菌/病毒為例）（上機操作） | 1、全基因組組裝的流程介紹 2、原始測序數(shù)據(jù)的預處理 3、分別介紹Velvet和SOAPdenovo的使用，并以一株細菌的測序數(shù)據(jù)為例進行組裝 4、介紹Newbler的是使用，并以一個IonTorrent測序的噬菌體數(shù)據(jù)為例進行組裝 5、以細菌的數(shù)據(jù)為例,介紹填補gap的方法，包括延伸法，局部拼接法 |
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| 第三天 | 基因組重測序與數(shù)據(jù)分析 | 1、講解基因組重測序的概念、目的與應用 2、結合實例講解其原理、類據(jù)類型與格式、操作流程、軟件等相關知識 |
| 基因組重測序數(shù)據(jù)分析實例（上機操作） | 1、 對二代測序數(shù)據(jù)的解讀 2、 數(shù)據(jù)質量控制及數(shù)據(jù)過濾 3、 使用BWA和Samtools進行數(shù)據(jù)比對并對比對結果進行可視化（重點講解） 4、 尋找SNP和Indel并進行注釋（重點講解） 5、 尋找結構變異并對變異進行注釋（重點講解） |
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| 第四天 | 轉錄組測序與數(shù)據(jù)分析 | 1、 轉錄組基本概況和技術發(fā)展簡介 2、 轉錄組技術流程及技術細節(jié)（重點講解） 3、轉錄組應用案例 |
| 轉錄組數(shù)據(jù)分析實例（上機操作） | 1、 轉錄組數(shù)據(jù)準備和軟件介紹及安裝 2、 轉錄組數(shù)據(jù)的比對（重點講解） 3、 表達量估計和分析（重點講解） 4、后續(xù)功能分析簡介 |
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| 第五天 | microRNA測序與數(shù)據(jù)分析 | 1、 microRNA目前的應用、發(fā)展歷史以及microRNA的定義 2、 microRNA的生物學過程（重點講解） 3、 microRNA的測序（重點講解） 4、 microRNA測序數(shù)據(jù)分析軟件（重點講解） 5、 microRNA目前的挑戰(zhàn)以及將來的研究前景 6、 microRNA測序數(shù)據(jù)分析案例展示（重點講解） 7、 近期文獻 |
| microRNA數(shù)據(jù)分析實例（上機操作） | 1、 microRNA測序數(shù)據(jù)預處理（重點講解） 2、 測序數(shù)據(jù)長度分布計算 3、 microRNA的預測（重點講解） 4、 microRNA堿基偏好性計算 5、 microRNA靶標基因預測，結果提取、統(tǒng)計（重點講解） |
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| 蛋白質組信息學平臺及應用 | 1、 蛋白質鑒定的質量控制 2、 非限制性蛋白質翻譯后修飾鑒定 3、 蛋白質定量分析 4、 蛋白質組數(shù)據(jù)管理 5、 案例分析 |
注：參加培訓班的學員投稿《中國生物工程雜志》，通過審稿的論文將會優(yōu)先發(fā)表。
授課教師：來自首師大、蛋白質中心、計算中心、軍科院，多個海歸博士，均在生物信息學領域有豐富的工作經(jīng)驗。
實際實用：理論講授和上機實習搭配，結合具體案例。
精致小班：每班少于35人，可根據(jù)學員課前提出的工作需求調(diào)整課程內(nèi)容。
VIP待遇：培訓后，仍可免費來我中心與生物信息專家一對一輔導。
效果保障：至今已經(jīng)成功舉辦多次生物信息分析專題培訓，累計百余人次，廣受學員好評。
報名費用：
| 報名種類 | 優(yōu)惠對象 | 注冊費①/折扣 | 贈送計算資源包月套餐② |
| A | 在校學生（需學生證） | 4950元/9折 | 1個月（價值3.5萬元）+終身VIP會員③ |
| B | 工作人員 | 5500元 | 2個月（價值7萬元）+終身VIP會員 |
�、僮再M含聽課費、資料費、上機費和午餐（主辦方可協(xié)助安排酒店）。請自帶筆記本電腦用以上機實習。
�、谫Y源數(shù)量含16核、32G內(nèi)存、100G存儲空間，有效期自培訓結束后生效，有效期6個月。
�、鬯袑W員自動成為VIP會員，永久享受生物計算分析服務9折優(yōu)惠。
【報名優(yōu)惠政策】
1、2014年11月1日前報名并繳費，可享受減免700元優(yōu)惠。11.15日前報名并成功繳費優(yōu)惠300元。
2、3人以上團體報名每人可減少400元；
3、4+1團報，可免費贈送一個名額
4、上面3種優(yōu)惠政策不能同時享受，只能享受其中一種。
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