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五行學說應用于病理方面,主要在于闡釋五臟病變的相互影響和相互傳變。主要表現為如下方面:一是相生關系的傳變,包括“母病及子”和“子病及母”兩方面。二是相克關系的傳變,包括“相乘”傳變和“相侮”傳變兩方面。并根據相生傳與相克傳,以推斷病情的輕淺或深重。故說:“邪挾生氣而來,則雖進而易退”;“受我之氣者,其力方旺,還而相克,來勢必甚。”“所不勝,克我者也,臟氣本已相制,而邪氣挾其力而來,殘削必甚,故為賊邪”;“所勝,我所克也。臟氣既受制于我,則邪氣亦不能深入,故為微邪。”
此外,五行學說還用以闡釋五臟發(fā)病與季節(jié)的關系。