線粒體嵴是能量代謝的明顯指征，但嵴的增多未必均伴有呼吸鏈酶的增加。嵴的膜和酶平行增多反映細胞的功能負荷加重，為一種適應狀態(tài)的表現(xiàn)；反之，如嵴的膜和酶的增多不相平行，則是胞漿適應功能障礙的表現(xiàn)，此時細胞功能并不升高。

在急性細胞損傷時（大多為中毒或缺氧），線粒體的嵴被破壞；慢性亞致死性細胞損傷或營養(yǎng)缺乏時，線粒體的蛋白合成受障，以致線粒體幾乎不再能形成新的嵴。

根據細胞損傷的種類和性質，可在線粒體基質或嵴內形成病理性包含物。這些包含物有的呈晶形或副晶形（可能由蛋白構成），如在線粒體性肌病或進行性肌營養(yǎng)不良時所見醫(yī)學|教育網搜集整理；有的呈無定形的電子致密物，常見于細胞趨于壞死時，乃線粒體成分崩解的產物（脂質和蛋白質），被視為線粒體不可復性損傷的表現(xiàn)。線粒體損傷的另一種常見改變?yōu)樗枨蕵訉訝罱Y構的形成，這是線粒體膜損傷的結果。

衰亡或受損的線粒體，最終由細胞的自噬過程加以處理并最后被溶酶體酶所降解消化。