測定酶的催化活性雖然是臨床上最常用的方法，但由于酶的催化活性不僅決定于酶的含量，還受多種因素的影響，如所用底物的性質及濃度、反應介質的PH、溫度、離子強度、激活或抑制因子等，因此具有方法依賴性。這是測定酶的催化活性存在的主要問題所在。因此對同一酶項目存在多種參考范圍，各實驗室間的結果缺乏可比性，室間質評用樣本的靶值難以確定，甚至有時會引起臨床上的誤診。國內各臨床實驗室間測定，酶活性結果的差異較大，明顯高于一般項目的測定結果。