中醫(yī)學發(fā)源于先秦，其理論體系形成于戰(zhàn)國到秦漢時期。中醫(yī)學理論體系是在中國古代哲學思想的影響和指導下，在中華民族傳統(tǒng)文化的基礎(chǔ)上，通過長期的醫(yī)療保健的經(jīng)驗積累和理論總結(jié)而形成的。

自然科學是關(guān)于物質(zhì)運動規(guī)律的理論知識體系。哲學是關(guān)于世界觀的學說，是人們對整個世界（自然、社會和思維）根本觀點的體系。任何一門自然科學的形成和發(fā)展都離不開哲學。必然受著哲學思想的支配和制約：特別是古代社會，哲學與自然科學尚未徹底分開之時，顯得尤為密切：中醫(yī)學屬于古代自然科學范疇，其理論體系始終沒有脫離古代自然哲學。中醫(yī)學以中國古代樸素的唯物論和自發(fā)的辯證法思想，即氣一元論、陰陽五行學說構(gòu)建其理論體系。哲學既是世界觀，又是方法論：氣一元論和陰陽五行學說不僅為中醫(yī)學提供了樸素的唯物辯證的自然觀和生命觀，皋確立了中醫(yī)學的整體的研究方法，使中醫(yī)學以聯(lián)系的、發(fā)展的、全面的觀點去認識自然、認識生命，借以闡明人與自然、生命本質(zhì)、健康與疾病等。醫(yī)學`教育網(wǎng)搜集整理中醫(yī)學運用哲學的概念和范疇，去觀察事物，借以闡明中醫(yī)學中的一系列問題，并貫穿于中醫(yī)學理論體系的各個方面，使之成為中醫(yī)理論體系的重要組成部分。這些哲學概念和范疇通過中醫(yī)學的診療實踐，得到了探索、驗證和深化，從而又豐富和發(fā)展了中國古代哲學理論。中醫(yī)學雖然來自長期的經(jīng)驗積累，但并沒有像其他經(jīng)驗科學而被科學實驗方法所淘汰，其根本原因在于中醫(yī)學理論充滿了樸素的唯物論和自發(fā)的辯證法思想，具有深刻的哲學淵源。