根據(jù)其發(fā)育階段，干細(xì)胞可分為胚胎干細(xì)胞（Embryonic Stem Cell）和成體干細(xì)胞（Adult Stem Cell）。

干細(xì)胞種類胚胎干細(xì)胞包括ES細(xì)胞（Embryonic Stem Cell）、EG 細(xì)胞（Embryonic Germ Cell）；成體干細(xì)胞包括神經(jīng)干細(xì)胞（Neural Stem Ce11，NSC）、血液干細(xì)胞（Hematopoietic Stem Cell，HSC）、骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞（Mesen chymal Stem Cell，MSC），表皮干細(xì)胞（EPidexmis Stem Cell）等。也有報(bào)導(dǎo)，按其分化潛能的大小，干細(xì)胞可分為三類：一是全能干細(xì)胞（Totipotent Stem Cell），二是胚胎干細(xì)胞（Embryonic Stem Cell），三是多能干細(xì)胞（Multipotent Stem Ce11）。 胚胎干細(xì)胞可來源于畸胎瘤細(xì)胞（EC）、桑椹球細(xì)胞（ES）、囊胚內(nèi)細(xì)胞團(tuán)（ES）、擬胚體細(xì)胞（ES）、生殖原基細(xì)胞（EG）等。 當(dāng)受精卵分裂發(fā)育成囊胚時，將內(nèi)細(xì)胞團(tuán)（Inner Cell Mass）分離出來進(jìn)行培養(yǎng)，在一定條件下，這些細(xì)胞可在體外“無限期”地增殖傳代，同時還保持其全能性，因此被稱為胚胎干細(xì)胞。胚胎干細(xì)胞在培養(yǎng)條件下，若加入白血病抑制因子LIF（Leu kaemia Inhlbitory Factor），則能保持在未分化狀態(tài)，若去掉LIF，胚胎干細(xì)胞迅速分化，最終產(chǎn)生多種細(xì)胞系，如肌肉細(xì)胞、血細(xì)胞、神經(jīng)細(xì)胞或發(fā)育成“胚胎體”。 干細(xì)胞按能力可以分為以下四類：

全能干細(xì)胞

由卵和精細(xì)胞的融合產(chǎn)生受精卵。而受精卵在形成胚胎過程中四細(xì)胞期之前任一細(xì)胞皆是全能干細(xì)胞。具有發(fā)展成獨(dú)立個體的能力。也就是說能發(fā)展成一個個體的細(xì)胞就稱為全能干細(xì)胞。

萬能干細(xì)胞

是全能干細(xì)胞的后裔，無法發(fā)育成一個個體，但具有可以發(fā)育成多種組織的能力的細(xì)胞。

多能干細(xì)胞

只能分化成特定組織或器官等特定族群的細(xì)胞（例如血細(xì)胞，包括紅血細(xì)胞、白血細(xì)胞和血小板）。

專一性干細(xì)胞

只能產(chǎn)生一種細(xì)胞類型；但是，具有自更新屬性，將其與非干細(xì)胞區(qū)分開。

成體干細(xì)胞可以由下列幾個方面得到：（1）胚胎細(xì)胞——由胚胎干細(xì)胞定向分化，或移植分化而成。（2）胚胎組織——由分離胚胎組織、細(xì)胞分離、或培養(yǎng)而成。 （3）成體組織——由臍血、新生兒胎盤、骨髓、外周血、骨髓間質(zhì)、脂肪細(xì)胞等得到。 干細(xì)胞是自我復(fù)制還是分化成為功能細(xì)胞，主要由于細(xì)胞本身的狀態(tài)和微環(huán)境因素所決定。干細(xì)胞本身的狀態(tài)，包括調(diào)節(jié)細(xì)胞周期的各種周期素（Cyclin）和周期素依賴激酶（Cyclin－Dependent Kinase）、基因轉(zhuǎn)錄因子、影響細(xì)胞不對稱分裂的細(xì)胞質(zhì)因子。微環(huán)境因素，包括干細(xì)胞與周圍細(xì)胞，干細(xì)胞與外基質(zhì)以及干細(xì)胞與各種可溶性因子的相互作用。

亞全能干細(xì)胞

亞全能干細(xì)胞自胚胎形成的第5到7天開始出現(xiàn)，能分化形成200多種人體組織器官細(xì)胞，但不能形成一個完整的人體。胎盤亞全能干細(xì)胞是來源于新生兒胎盤組織的一族亞全能干細(xì)胞，其在發(fā)育階段與胚胎干細(xì)胞接近，具備分化形成三個胚層的組織細(xì)胞的能力，但不會形成畸胎瘤。