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水體受到生物性污染后最常見的危害是居民通過飲用、接觸等途徑而引起介水傳染病的暴發(fā)流行，對人體健康造成危害。這類疾病包括霍亂、傷寒、痢疾、肝炎等腸道傳染病及血吸蟲病、賈第蟲病等寄生蟲病以及鉤端螺旋體病等。水體生物性污染主要來源于人畜糞便和生活污水的排放。

在富營養(yǎng)化水體中藻類大量繁殖聚集成團塊，漂浮于水面影響水的感官性狀。有些藻類能產生毒素如麻痹性貝毒、腹瀉性貝毒、神經性貝毒等，而貝類能富集此類毒素，人食用了毒化的貝類后可發(fā)生中毒甚至死亡。藻類毒素一旦進入水中，一般供水凈化處理和家庭煮沸不能使之全部失活。

致病性微生物的水污染在發(fā)展中國家是水污染的突出問題，值得高度重視。

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